1、承包人主张预付款、进度款，其诉讼时效为按合同约定的支付期限提出付款要求后二年。

2、承包人主张工程结算款，其诉讼时效自工程通过工程竣工质量验收、承包人提交竣工结算报告后二年，为发包人工程价款的确认时效，

如工程价款结算已经确定，自确认之日后二年为承包人的返还时效，如承包人送出工程价款结算报告，发包人在二年未确认结算款，承包人的返还时效最长为4年。

3、承包人主张签证、索赔增加的工程款，诉讼时效为提交签证、索赔资料后二年；如合同约定除斥期间的，除斥期间届满，当事人丧失时效。

一、工程质量保证金可以预留吗

（一）两种情况，不得预留工程质量保证金

1、在工程项目竣工前，已经缴纳履约保证金的，发包人不得同时预留工程质量保证金。

2、采用工程质量保证担保、工程质量保险等其他保证方式的，发包人不得再预留保证金。

保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的5％。合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于工程价款结算总额的5％。

逾期未返还，应支付违约金，并在招标、合同文件中明确

发包人应当在招标文件中明确保证金预留、返还等内容，并与承包人在合同条款中对涉及保证金的下列事项进行约定：

（1）保证金预留、返还方式；

（2）保证金预留比例、期限；

（3）保证金是否计付利息，如计付利息，利息的计算方式；

（4）缺陷责任期的期限及计算方式；

（5）保证金预留、返还及工程维修质量、费用等争议的处理程序；

（6）缺陷责任期内出现缺陷的索赔方式；

（7）逾期返还保证金的违约金支付办法及违约责任（新增条款）。

缺陷责任期最长2年，从工程通过竣工验收之日起，自动进入缺陷责任期。

缺陷责任期一般为1年，最长不超过2年，由发、承包双方在合同中约定。

二、安徽省施工合同纠纷的诉讼时效是多久

1、工程质量缺陷不适用“出售质量不合格的商品未声明的”一年的短期时效，而适用一般诉讼时效为二年。

2、施工过程中出现的地基基础、主体结构以及竣工验收各阶段的施工质量缺陷争议，其诉讼时效自阶段质量验收发现缺陷或阶段质量验收未通过时起算；如质量缺陷争议已委托鉴定的，自鉴定单位出具鉴定意见后二年。

3、如合同约定发包人提出质量缺陷主张有除斥期间的，发包人在除斥期限届满未主张即丧失诉讼时效。发包人未经竣工质量验收或验收不合格便擅自使用工程，丧失主张一般部位和重要部位的诉讼时效，司法解释第13条对此有明确的规定。

4、工程交付使用后，发包人主张承包人的工程保修责任，诉讼时效根据工程不同部位的最低保修年限而定：

(1)工程一般部位即一般土建、装修和管道工程的保修责任，诉讼时效为合同约定的不少2年的保修年限后二年；

(2)工程重要部位即有防水要求的屋面、墙面、卫生间的保修责任，诉讼时效为合同约定的不少5年的保修年限后二年；

(3)工程主要部位即地基基础和主体结构的保修责任，诉讼时效根据工程设计的不同结构形式而定：

农村的砖木结构的房屋为不少于设计年限30年后二年；

城市的砖和混凝土结构的房屋为不少于设计年限50年后二年；

城市的钢筋混凝土结构的房屋为不少于设计年限70年后二年，上述案件法律据此受理完全正确；

城市的钢结构房屋为不少于设计年限100年后二年。

5、对承包人在缺陷责任期内应保修而未保修的责任，发包人的诉讼时效为缺陷责任期届满后二年。

程款纠纷案件有关确认时效和返还时效的特殊性