可以选择适用简易计税方法，以取得的全部价款和价外费用减去取得该土地使用权的原价后的余额为销售额，按照5%的征收率计算缴纳增值税。截止目前财政部和国税总局并未出台文件对小规模纳税人转让土地使用权收入单独规定不是3%的征收率，因此，小规模纳税人转让土地使用权如果全额纳税的税率是3%.

一、不动产销售税率

（1）根据《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号文）规定：

小规模纳税人销售其取得（不含自建）的不动产（不含个体工商户销售购买的住房和其他个人销售不动产）应以取得的全部价款和价外费用减去该项不动产购置原价；

或者取得不动产时的作价后的余额为销售额，按照5％的征收率计算应纳税额。纳税人应按照上述计税方法在不动产所在地预缴税款后，向机构所在地主管税务机关进行纳税申报。

（2）小规模纳税人销售其自建的不动产，应以取得的全部价款和价外费用为销售额，按照5％的征收率计算应纳税额。

纳税人应按照上述计税方法在不动产所在地预缴税款后，向机构所在地主管税务机关进行纳税申报。

二、股东以土地出资入股需要缴纳什么税

股东以土地出资入股出让方需缴纳以下税种：1、营业税：根据《关于营业税若干政策问题的通知》第三条第二十款之规定，单位和个人受让的土地使用权，以转让土地使用权取得的全部收入减去土地使用权的购置或受让原价后的余额为营业额，按照5%的税率征收营业税。2、城市维护建设税和教育费附加：以上述营业税额为计税依据，分别按照5%和3%的税率征收城市维护建设税和教育费附加。3、土地增值税：按照累进税率征收土地增值税。4、企业所得税：按新企业所得税法规定，以转让土地使用权取得的全部收入减去土地使用权的购置或受让原价、营业税、城市维护建设税和教育费附加和土地增值税后的余额为应纳税所得额，一般按照25%的税率征收企业所得税。5、印花税：根据《印花税暂行条例》的规定，土地使用权转让合同属于产权转移书据，以合同中的金额为计税依据，按万分之五的税率征收印花税。

三、小规模纳税人增值税税率是多少

增值税对小规模纳税人采用简易征收办法，对小规模纳税人适用的税率称为征收率。

考虑到小规模纳税人经营规模小，且会计核算不健全，难以按增值税税率计税和使用增值税专用抵扣进项税额，因此实行按销售额与征收率计算应纳税额的建议办法。小规模纳税人增值税征收率一律为3%。

小规模纳税人(除其他个人外)销售自己使用过的固定资产，减按2%征收率征收增值税。只能够开具普通发票，不得由税务机关代开增值税专用发票。