用人单位可以代扣劳动者的工资的情形主要是《工资支付暂行规定》中规定的四种。另外，如果因劳动企业代扣劳动者工资的情形者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定和《工资支付暂行规定》的规定，在工资中扣除劳动者应承担的赔偿款。

企业代扣的情况

代扣代缴个人所得税是行政法规税法规定的义务。法院属于司法执法。不是行政执法。法院判企业支付工资，企业执行司法程序按判决书支付工资。同时企业又必须执行税务行政法规，支付工资时代扣个人所得税。这是企业执行必须执行的两个法。即执行司法法规和执行行政法规。

不能司法执法代替行政执法。通俗的说就是法院判决支付工资，税法规定支付工资代扣代缴个人所得税。所以有法院和税务局两个部门。司法执法和行政执法。不支付工资法院可以判你支付工资。不代扣代缴个人所得税，税务局执行“扣缴义务人应扣未扣，应收未收税款的，由扣缴义务人缴纳应扣未扣，应收未收税款以及相应的滞纳金或罚款。”

《个人所得税法》第八条的规定：“个人所得税，以所得人为纳税义务人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。”

《个人所得税代扣代缴暂行办法》第十一条也指出：“扣缴义务人应扣未扣，应收未收税款的，由扣缴义务人缴纳应扣未扣，应收未收税款以及相应的滞纳金或罚款。”

员工的加班工资没有发放的情况下，可以向用人单位要求赔偿，拒不赔偿的可以通过劳动仲裁来进行处理，但是对于相关情况的认定上应当严格按照法律规定的情况来处理，特别是对于个税的缴纳上，可以向税务部门咨询具体的起征额度来处理。

《工资支付暂行规定》第十五条用人单位不得克扣劳动者工资有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。