在合同中规定违约金可以在应付货款中扣除可以有效确保权益,但需要注意违约金的合理性和合同具体规定。一旦违反合同规定,则应严格按照约定执行,避免产生法律风险。

在应付货款中扣除违约金等罚款存在法律风险，因此一般不被允许。为确保权益，应严格按照合同规定行事。请问您当时在拟定合同时是否规定了违约金可以在应付货款中扣除？如规定如此，则可在应付货款中扣除。合同主要讲究契约自由原则，因此应根据合同具体规定。

合同规定下如何处理违约金？

根据合同规定，当事人可以约定违约金的数额。如果一方违约，另一方有权要求违约方支付违约金。违约金的性质属于一种责任，而非一种惩罚。当事人可以就违约金的违约责任与违约责任同时作出约定。当事人没有约定违约金或者约定不明确，按照合同有关条款或者交易习惯确定。如果仍然不能确定违约金的数额，可以请求人民法院或者仲裁机构根据实际情况确定。当事人可以约定违约金的方式，包括定金或者违约金，但不得与损失赔偿并用。另外，当事人也可以约定在违约金逾期后一定期限内仍不履行的，守约方可以请求人民法院或者仲裁机构根据逾期情况确定违约金数额。因此，当事人应当在合同中明确违约金的数额、违约责任承担方式以及逾期履行的处理方式，以避免发生纠纷。

在合同中规定违约金的存在可以有效约束双方，确保权益。因此，在拟定合同时应明确规定违约金的数额、违约责任承担方式以及逾期履行的处理方式。这样可以避免在应付货款中扣除违约金等罚款所带来的法律风险。同时，当事人还可以根据交易习惯或者实际情况来确定违约金的性质，以避免发生纠纷。

《中华人民共和国民法典》

第五百七十七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

第五百七十八条当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满前请求其承担违约责任。

第五百七十九条当事人一方未支付价款、报酬、租金、利息，或者不履行其他金钱债务的，对方可以请求其支付。

第五百八十四条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。