1、重大决策的制定。谁控制了董事会，就控制了公司，拥有对重大决策的制定权。大股东可以很容易做到控制董事会。通常，股东协议书可以有一个条款，规定一些特定的决策需要全体股东的批准。这种规定可以保护小股东的利益。

2、融资安排和股东给公司的贷款。公司运作起来经常需要股东投钱进来，为了保障投钱股东的利益，可以考虑拿公司的资产来抵押给投钱股东，并且支付合理的利息。

3、股份转让条款，指一个股东想买断另一个股东时如何处理的条款。一个常见的规定是，一方可以提出买断另一方股份的提议和出价，另一方有权决定接受还是拒绝。如果另一方拒绝，则必须要反过来按原来的出价买断提议方的股份。这种规定提供了对双方利益的保护和一个有效的股东退出机制。

4、股东离婚时导致股份被分割给前配偶时如何处理。可以考虑制定一个买断条款，公司(或其他股东)有权买断转给前配偶的股份。

5、股东有意外时，如死亡、残废时，如何处理。

一、企业合作是合伙协议好还是股东协议好

企业合作合伙协议与股东协议各有各的好处，无法评判其好坏。股东协议是公司内股东之间的协议，个人合作协议更纯粹个合作协议，之间存在的较明显的区别。个人合伙是指两个及其两个以上公民按照协议，各自提供资金、实物、技术等，共同经营、共同劳动、共担风险、共负盈亏的自愿联合。

二、合伙协议法律特征

1、合伙须有两个及其以上的公民;

2、合伙是按合伙合同联合起来的经济单位;

3、合伙人必须共同出资、共同经营、共同劳动、共担风险;

4、合伙财产归全体合伙人共有，合伙人对合伙债务承担连带责任。个人合伙应当签订合伙协议。合伙协议是指明确合伙人之间权利义务关系的协议。当事人未订立书面协议，但具备合伙条件，又有两个以上无利害关系人证明有口头协议的，人民法院可以认定其具有合伙关系。

现如今由于人们的需求不同，衍生出来的新的行业越来越多，造成行业之间的竞争也是越来越激励。一些企业为了在竞争中脱颖而出会选择一些企业进行合作，不仅仅能发展自身业务，同时也能带动合作企业的发展，最终在行业中有自身的发展余力。