本罪的主体是一般主体。但一般必须是出入国（边）境的人才可能构成本罪。不出入国（边）境的人，不会直接成为本罪的主体。单位也可以成为本罪主体。根据《国境卫生检疫法》及其《实施细则》的有关规定，本罪主体具体包括下列几类人员和单位：

1、入境、出境的旅客。无论乘坐船舶、飞机、列车等交通工具入境、出境的旅客，还是徒步入境、出境的旅客都可以成为本罪的主体。

2、入境、出境的交通工具上的员工。这类人员在入境、出境时与普通旅客一样负有接受国境卫生检疫的义务。

3、入境、出境的集装箱、货物、废旧物品的承运人、代理人或者货主。这类人员在其所承运、代理、所有的上述物品入境、出境时，应当向国境卫生检疫机关申报并接受卫生检疫。

4、入境、出境的微生物、人体组织、生物制品、血液及其制品或者其他可能引起传染病传播的动物等特殊物品的携带人、托运人或者邮递人。

5、入境、出境的尸体、骸骨的托运人或者代理人。上述人员在尸体、骸骨入境、出境时，没有申请卫生检疫的，或者逃避、拒绝接受卫生检疫机关对不符合卫生要求的尸体、骸骨实施的卫生处理的，或者未经卫生检疫机关签发尸体、骸骨入境、出境许可证而擅自将其运进、运出的，或者擅自移运经查验系因患检疫传染病而死亡的病人尸体的，就有可能成为本罪主体。

6、邮政部门或者邮政工作人员。未经卫生检疫机关许可，邮政部门不得运递邮包进出境。若邮政部门或者其工作人员违反该规定，引起检疫传染病传播或者有传播严重危险的，则可成为本罪主体。

7、入境、出境的交通工具的负责人。入境、出境的交通工具的负责人，主要是指运送旅客、货物或者其他物品入境、出境的船舶、飞机、列车等交通工具的负责人。此外，还包括来自国外的因故停泊、降落在中国境内非口岸地点的船舶、航空器的负责人。

8、国境口岸的有关单位或其直接负责的主管人员和其他直接责任人员以及国境口岸交通工具的负责人。

9、引航员和其他人员。对染疫船舶、染疫嫌疑船舶上的引航员和经卫生检疫机关许可上船的人员应当视同员工接受有关卫生处理。此外，在入境检疫以及必要的卫生处理完毕之前或者出境检疫以及必要的卫生处理完毕之后，上下交通工具的其他人员也有义务接受或者再次接受卫生检疫机关的检疫。