两个孩子的抚养权由孩子自己协商确定，如果无法协商的，则法院根据综合考虑孩子现在的生活状态、夫妻双方的工作收入及道德方面等因素，按照有利于子女健康成长的原则来判决孩子抚养权归属。对于有两个孩子的这种情况，法院可能会判决一方抚养一个孩子。

如果两个孩子都不满两周岁的，则法院可能会判决两个孩子都由女方来抚养。

如何确定抚养权归属的？

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养和教育的权利和义务。子女抚养权的归属具体如下：

1、两周岁以下的子女，一般随母亲生活。母亲有下列情形之一的，可随父方生活：

（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；

（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；

（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。

2、对两周岁以上未成年的子女，父亲和母亲均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：

（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；

（2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；

（3）无其他子女，而另一方有其他子女的；

（4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。

3、父母双方对八周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。

离婚抚养权可以另行处理，孩子的抚养权只有两种归属问题，要么归父亲所有，要么归母亲所有，办理离婚手续时，孩子年纪较小，在两周岁以下，抚养权是归母亲所有的。如果是两周岁以上的未成年子女，要考虑父母的经济条件，才能决定抚养权。

《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。