一、农村宅基地确权出现问题后应该如何妥善处理

对农村房屋确权有争议的，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。对处理结果有异议的。可以向法院起诉。

法律依据：

《中华人民共和国土地管理法》第十四条

土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

二、宅基地会被什么情况下收回

1．政府征用的情况。在有的特殊情况下，政府会进行基础设施建设，如修路、修建筑物的情况。这样的宅基地在政府征用后，自然是会被回收，但政府也会给予相应的补偿。

2．乱建宅基地、一户多宅的情况。宅基地是的建筑范围是在村集体划分的范围内，而不在规定范围内的宅基地是视为非法的，对这种乱建宅基地是会被回收的。根据土地确权的原则，一户中能有一个宅基地，尽管有多的宅基地，但只会对其中一个宅基地进行确权。

3．村里五保户遗留的宅基地的情况。村里五保户的宅基地由于没有子女来继承，所以他的宅基地将会被村集体回收。

4．被废弃的宅基地的情况。由于城镇化的不断推进，越来越多的农村人进到城市打工，导致农村土地的荒废。为了资源的合理回收利用，政府将会回收这一部分的土地，也会对房主进行相应的补偿。

5．城市户口的居民继承了在农村的宅基地的情况。农村的宅基地是不能继承给城镇户口的居民的。虽然能够继承农村宅基地上的房屋，但土地不能。等到房屋被毁坏后，村集体将会对宅基地进行回收。

6．城镇居民违规购买的宅基地的情况。

三、农村宅基地纠纷法院会立案处理的时间是多久

起诉书上交到法院后，符合起诉条件的，人民法院会在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十六条人民法院应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百二十二条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。

《中华人民共和国土地管理法》（2019修正）：第二章　房地产开发用地 第一节　土地使用权出让　　第十四条　土地使用权出让最高年限由国务院规定。