在股权转让协议纠纷中，如果双方当事人对管辖法院有约定且约定有效的，应适用其约定;没有约定或约定不明，应适用法律规定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。

一、合同纠纷合同纠纷可以在原告所在地起诉吗

合同纠纷中，在原告所在地法院管辖的情况有以下两种：第一种情况：双方合同中约定由原告住所地法院管辖；第二种情况：合同履行地在原告住所地。《民事诉讼法》第34条规定，合同或其他财产权益纠纷的当事人可以书面约定选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。依据上述规定，双方当事人可以在合同中约定管辖法院。如果在合同中没有约定，就应该根据《民事诉讼法》第23条规定，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。合同的履行地，也可以在合同中进行约定。没有约定的，则应该根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第18条的规定来确定合同的履行地。

二、合同诉讼管辖法院如何选择

一、当事人想约定管辖时，在不违反法院级别管辖和专属管辖的情况下可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖。

二、当事人已经约定管辖的，以约定的为准。

三、当事人没有约定管辖的，通常由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

四、其他由法律规定的管辖法院

1、因保险合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者保险标的物所在地人民法院管辖。

2、因票据纠纷提起的诉讼，由票据支付地或者被告住所地人民法院管辖。

3、因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。

4、因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。

三、合同纠纷去哪里去解决呢

在合同履行过程中如果发生争议，合同双方又协商不成的情况下，向法院提起诉讼是一种比较有效的解决纠纷的方式。但是应该向哪个法院起诉，也是当事人比较迷茫的。关于合同纠纷归向哪个法院起诉，首先，要看合同双方在合同中是否约定了管辖法院，如果约定了管辖法院，就应当在合同约定的法院提起诉讼。那如果合同中没有约定的话，根据法律规定，应当向被告地或合同履行地法院提起诉讼。那是不是没有约定管辖的都是被告所在地或合同履行地呢?有例外的，如果是买卖合同纠纷、借款合同纠纷是可以在接受货币一方所在地法院提起诉讼的，也就是原告所在地。另外，如果是因不动产纠纷提起的诉讼，是由不动产所在地人民法院管辖，这个是法定管辖，其他约定是无效的。