合法自建房可以获得赔偿。非基于民事法律行为的物权变动中，因合法建造房屋等事实行为设立物权的，自事实行为成就时当事人即取得物权。所以合法自建房属于事实行为而获取的物权房产，在征收使用时是可以获得赔偿的。

农村如果只有土地使用证可以建房吗

一、村委研究通过

村委在研究村民建房申请时，支部书记负责召集，召开由村两委成员和部分党员、村民代表共同参加，管区派员列席研究的专题会议。对提出申请建房的村民资格进行审查，即审查是否符合申请建房的条件。与会三分之二以上同意视为通过，张榜公布七日无异议后，管区工作人员、村支部书记、村主任、村经办人签字盖章后再加盖村委公章，分别报镇村建设服务中心与国土资源所申请批准。

二、公示

审查完毕后，村委将研究通过的建房户的名单、位置、面积等情况在村内进行公示，公示时间不得少于7天。

三、现场勘察和初审

公示七日无异议后，村两委成员、镇村建设服务中心、国土资源所、财政所到现场进行实地勘察，填写《农村村民建房、宅基地使用申请书》。镇村建设服务中心、国土资源所根据村镇规划和土地利用总体规划进行现场初审，并提出用地和规划建设的要求。

四、镇政府审查

由领导小组研究审批，各成员单位会签后由镇长签字，批准后，到镇镇村建设服务中心填写《村镇规划选址意见书申请审批表》，由镇村建设服务中心上报市城乡建设局批准；批准后持《村镇规划选址意见书申请审批表》、户口薄、身份证有关证件到镇国土资源所填写《宅基地批准证书》，办理宅基地审批手续，上报市人民政府批准。

五、定点放线

审批完毕后，建房户提供出四邻同意建房的证明材料，由管区、村两委主要成员会同国土资源所、镇村建设服务中心到现场定点放线，并填写现场定点放线记录，由管区、支部书记、服务中心放线人员签字。

六、申报登记

房屋建成经镇镇村建设服务中心会同国土资源所验收合格后，到国土资源所办理《集体土地使用证》，持土地使用证到镇村建设服务中心办理《房屋所有权证》。

《民法典》

第二百三十一条因合法建造、拆除房屋等事实行为设立或者消灭物权的，自事实行为成就时发生效力。

《土地管理法》

第四十八条征收土地应当给予公平、合理的补偿，保障被征地农民原有生活水平不降低、长远生计有保障。