分公司中标总公司签合同是不合法的，分公司中标后，如果由总公司签订合同，这样是违规的，合同无效，中标人应当按照合同约定履行义务，完成中标项目。中标人不得向他人转让中标项目，也不得将中标项目肢解后分别向他人转让。中标人按照合同约定或者经招标人同意，可以将中标项目的部分非主体、非关键性工作分包给他人完成。接受分包的人应当具备相应的资格条件，并不得再次分包。中标人应当就分包项目向招标人负责，接受分包的人就分包项目承担连带责任。

分公司虽然不是独立的法人，但是一般也是领取营业执照了的，可以在总公司的授权范围内从事经营活动，可以对外签订合同。而且可以自己的名义对外签订合同，就是并不一定需要盖总公司公章，可以盖分公司自己的公章。分公司的存在，就是为了帮总公司开拓市场，方便总公司的经营，并不是事事都需要过问总公司的，如果分公司连对外签订合同的资格都没有，那就不符合总公司设立它的初衷了。

一、中标后签订合同有哪些注意事项？

1、招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。

2、招标人与中标人招标文件和中标人的投标文件订立合同的，或者招标人、中标人订立背离合同实质性内容的协议的，责令改正；可以处中标金额千分之五以上千分之十以下的罚款。

3、中标人不履行与招标人订立的合同的，履约保证金不予退还，给招标人造成的损失超过履约保证金数额的，还应当对超过部分予以赔偿；没有提交履约保证金的，应当对招标人的损失承担赔偿责任。

4、中标人不按照与招标人订立的合同履行义务，情节严重的，取消其二年至五年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。

二、设立分公司程序

1、持公司名称预先核准申请书、授权书到工商局办理核名。

2、核名后，持工商局发给的核名通知书到相关部门办理前置审批手续。

3、填写分公司设立登记申请书，由总公司盖公章并由法定代表人签字。

4、填写指定代表证明，由总公司盖公章并将指定代表人的身份证贴上。

5、准备分公司营业场所使用证明；自有房产提交产权证；租赁房屋提交租赁协议以及出租方的房产证。