港澳通行证是查不出吸毒史的，往来港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国出入境管理局（即国家移民管理局，一个机构两块牌子）签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件，不涉及个人的吸毒史。

一、有吸毒史可以办理港澳通行证吗

有吸毒史能办理港澳通行证的，这不属于不允许出境的范围。

根据《中华人民共和国公民出境入境管理法》第八条规定：有下列情形之一的，不批准出境：

（一）刑事案件的被告人和公安机关或者人民检察院或者人民法院认定的犯罪嫌疑人；

（二）人民法院通知有未了结民事案件不能离境的；

（三）被判处刑罚正在服刑的人；

（四）正在被劳动教养的人；

（五）国务院有关主管机关认为出境后将对国家安全造成危害或者对国家利益造成重大损失的人。

二、港澳通行证的办理流程是怎样的

（一）新办

首次办理须本人至当地的出入境管理处提交申请，申请材料有：居民身份证及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）以及填写《中国公民出入境证件申请表》，2寸淡底色彩照2张（也可现场拍照，费用自付），同时分别申请赴香港、澳门的签注。只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。

【办理时限】自受理之日起10个工作日（首次或非首次申请）。但均不含邮递日（一般在五天左右）以及节假日。

【费用】《往来港澳通行证》每本60元；一次往来签注，每个15元，二次往来签注每个30元。

（二）续签

本人凭身份证及有效的《往来港澳通行证》办理，也可代办，代办人需携带身份证。（不同城市对加签可能有特殊规定，具体咨询户籍所在地公安机关出入境管理部门，少数城市可以邮寄续签，如江苏连云港市）

【办理时限】自受理之日起7个工作日。

【费用】一次往来签注每个15元；二次往来签注每个30元。

【特别注意】《往来港澳通行证》有效期不足6个月（部分城市是3个月）的或无足够空白签注页的不能办理，须按首次申请手续办理新的《往来港澳通行证》，同时申请签注。

（三）代办

若是首次申请办理港澳通行证需要携带本人身份证以及照片；若非首次申请，则需带好本人身份证及前一次办理的通行证，如请人代办还需携带代办人身份证。