行政处罚没收的假冒农药应当按照行政处罚法的相关规定处理。《行政处罚法》关于没收非法财物的规定，除依法应当予以销毁的物品外，依法没收的非法财物必须按照国家规定公开拍卖或者按照国家有关规定处理。

一、如何确定违法所得

根据刑事诉讼法及最高人民法院的司法解释规定，下列财产属于应当予以没收的财产：

违法所得：实施犯罪行为取得的财产及其孽息，如贪污、受贿所得等。

涉案其他财产：犯罪嫌疑人、被告人非法持有的违禁品、供犯罪所用的本人财物，为刑事诉讼法所规定的应当予以没收的涉案其他财产。违禁品如非法持有的枪支弹药等。“供犯罪所用的本人财物”之表述，即是将该类财物严格限定于供犯罪所用且系本人所有的物品。虽是供犯罪所用，但非犯罪嫌疑人、被告人本人财物的，不在本程序规定的没收之列。如犯罪嫌疑人或被告人以自己所有的房屋作为预谋、策划犯罪的聚集点时，该房产将来即可能会作为涉案其他财产被依法没收。

二、没收财产房子该如何处理

没收的房子是要依法上缴国库的，有的会在拍卖后，将价款上缴。对查获的下列物品，可以不交财政部门，经县以上人民法院院长、检察院检察长和公安局局长批准后，根据不同情况，分别处理：1、罪犯用以进行犯罪的工具和留有犯罪痕迹的物品，需要作为罪证保存的，一般应当拍照存入案卷，原物随卷归档保管。2、武器弹药、易燃易爆等危险物品，加以拍照，照片存入案卷，原物送专门机关处理。3、反动书画，有证据作用的，应当归档保管，无证据作用的，可以销毁。4、黄色书刊图片，应指定专人另行保管，案件办理结束，即行销毁或送有关单位。5、对没收的各种生活供应票证，经领导审查后，分别送交有关部门处理或在案卷内注明，自行销毁。通知失主后，超过半年未来领取的，予以没收，送财政部门处理。如有特殊情况，可以酌情延期处理。凡是已经送交财政部门处理的赃款赃物，以后如有失主前来认领，并经查证属实，由原没收机关从财政部门提回，予以归还。如原物已经卖掉，应该按卖价退还现款。

三、关于行政处罚没收的违章工具的规定

除依法应当予以销毁的物品外，依法没收的非法财物必须按照国家规定公开拍卖或者按照国家有关规定处理。

罚款、没收的违法所得或者没收非法财物拍卖的款项，必须全部上缴国库，任何行政机关或者个人不得以任何形式截留、私分或者变相私分。

罚款、没收的违法所得或者没收非法财物拍卖的款项，不得同作出行政处罚决定的行政机关及其工作人员的考核、考评直接或者变相挂钩。除依法应当退还、退赔的外，财政部门不得以任何形式向作出行政处罚决定的行政机关返还罚款、没收的违法所得或者没收非法财物拍卖的款项。