不可以。下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：1、应当从工伤保险基金中支付的。2、应当由第三人负担的。3、应当由公共卫生负担的。4、在境外就医的。社保的医保（包括互助医疗）对于交通事故是不报销的，只能是由肇事方负责赔偿，但是医疗保险可以报销部分药物的钱。

交通事故自己全责能用合作医疗报销

交通事故自己全责如果没有获得相关的赔偿的话，那么是可以利用新农村合作医疗保险来进行赔付了，发生交通事故报警后新农村合作医疗还能否报销，关键是当事人在事故中的医药费损失有没有得到合理赔偿，已经取得了赔偿的，负责赔偿的一方已经把医药费发票拿去了，那么，新农村合作医疗保险也就不能给予保险了。如果，这个交通意外事故是个人单方面肇事，没有涉及到交通事故理赔或者单位工伤保险报销的，那么，即使是报警了，最后凭交警没有事故责任方赔偿和企业无工伤赔偿的相关证明，还是可以申请报销的。

当然，假如当事人在事故中个人承担了责任的，凭公安机关的事故认定书和法院的事故处理调解书，判决书等等司法证明材料，可以凭医药费发票的复印件，申报报销没有获得赔偿的部分损失。另外，还可以依据事故处理中，保险公司给予的理赔分割单和加盖了保险公司理赔专用章的医药费发票复印件去申报新农村合作医疗的医药费报销。

法律依据：《道路交通安全法》

第七十四条

对交通事故损害赔偿的争议，当事人可以请求公安机关交通管理部门调解，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。

经公安机关交通管理部门调解，当事人未达成协议或者调解书生效后不履行的，当事人可以向人民法院提起民事诉讼。

《中华人民共和国社会保险法》

第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

第三条社会保险制度坚持广覆盖、保基本、多层次、可持续的方针，社会保险水平应当与经济社会发展水平相适应。

第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。

个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。

第三十条下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：

（一）应当从工伤保险基金中支付的；

（二）应当由第三人负担的；

（三）应当由公共卫生负担的；

（四）在境外就医的。

医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。