连续两年不在一起也不能自动离婚，我国《民法典婚姻编》（自2021年1月1日起实施）没有自动离婚的提法或规定，夫妻感情的确破裂的，且分居二年以上的，经法院调解无效的，(一般二次起诉后)法院判决准予离婚。公民只有通过下述两种途径才能解除婚姻关系：

1、协议离婚。夫妻双方均同意离婚，对于子女抚养、财产分割、债务处理等问题自愿达成一致意见，向婚姻登记机关申请离婚，婚姻登记机关核准后颁发离婚证。

2、诉讼离婚。夫妻一方愿意离，另一方不愿离；或双方均愿意离婚，但对子女抚养、财产分割、债务处理等问题达不成一致意见时，夫或妻一方向人民法院起诉要求离婚，法院根据法律规定判决或调解解除婚姻关系。

一、法院判决离婚的依据是什么？

我国现行《民法典》第一千零七十九条第二款规定：“人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。”“感情确已破裂”作为准予离婚法定条件。

因此，法院在审理离婚案件时，是根据夫妻双方当事人的感情是否确已破裂为依据来判决离婚的。而有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：

(一)重婚或有配偶者与他人同居的；

(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；

(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的；

(四)因感情不和分居满二年的；

(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。

二、可以申请协议离婚的条件是什么？

根据《民法典》、《婚姻登记条例》之规定，协议离婚的条件是：

1、协议离婚的当事人双方必须具有合法的配偶身份，也即依法办理了结婚登记的合法夫妻；

2、双方自愿离婚；即双方当事人对离婚问题达成一致的意思表示。因受他人或对方欺诈、胁迫或重大误解所作出的离婚意思表示无效；

3、要求离婚的夫妻双方共同到具有管辖权的婚姻登记处提出申请；

4、双方均具有完全民事行为能力；

5、当事人持有离婚协议书，协议书中载明双方自愿离婚的意思表示以及对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致的意见；

6、当事人持有内地婚姻登记机关或者中国驻外使(领)馆颁发的结婚证；

7、当事人各提交2张2寸单人近期半身免冠照片；

8、当事人持《婚姻登记工作暂行规范》第二十三条至第二十八条规定的身份证件，即常住户口簿和居民身份证。