覆盖人群不同。职工医保主要覆盖企业职工、灵活就业人员等；新农合主要覆盖农村户籍居民。缴费标准不同。职工医保的缴费标准要远远高于新农合。且职工医保按月缴费，退休后不再缴费；新农合按年度缴费，且要终身缴费。待遇不同。职工医保由于筹资水平远远高于新农合，所以所享受的医保待遇也远远高于新农合。

新农合跟医保的区别

新农合跟医保的区别分为两类，分别如下：

1、参保对象及缴费依据不同：职工医保不区分户口性质，只要实现就业或者是无雇工的个体工商户、灵活就业人员都可以参保，以所在用人单位的上一年度平均工资为征收依据；城镇医保仅限于本辖区内的“非农业户口”人员参保，实行的是政府补助及参保人缴纳剩余部分的方式缴费；

2、两者的享受待遇不同：职工医保的只要退休前缴费达到一定的年限如：25年，退休后，每月医保卡会打入一定的待遇，城镇医保仅限于参保当年享受，没有退休待遇；同等条件下，职工医保的缴费基数及报销比例都大于城镇医保。

基本医疗保险支付范围仅限于规定的基本医疗保险药品目录、诊疗项目和医疗服务设施标准内的医疗费用；对提供基本医疗保险服务的医疗机构和药店实行定点管理；社会保险经办机构与基本医疗保险服务机构（定点医疗机构和定点零售药店）要按协议规定的结算办法进行费用结算。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第三十条

下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：

（一）应当从工伤保险基金中支付的；

（二）应当由第三人负担的；

（三）应当由公共卫生负担的；

（四）在境外就医的。

医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。

第三十一条

社会保险经办机构根据管理服务的需要，可以与医疗机构、药品经营单位签订服务协议，规范医疗服务行为。

医疗机构应当为参保人员提供合理、必要的医疗服务。

《中华人民共和国社会会保险法》第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。