企业扣除部分工资作为年终奖发放不合法。工资应当按照约定标准按月支付给职工本人，不得克扣或者无故拖欠。企业扣除职工的工资作为年终奖的行为属于违法，职工可以向当地的劳动监察部门进行投诉或者直接申请劳动仲裁。

年终奖的三种发放形式

第一、garanteedbons（有保证的奖金）：如外企普遍采用的13薪或14薪或更多，只要员工在年底仍然在岗，无论他个人的表现如何，无论公司的业绩如何，全员享受，属于普惠，类似于福利性质，表示公司对员工一年来苦劳的感谢。这里的发放规则是全员一致的，是公开的，具体数额就与每个人的基本工资水平相关了。

第二、variablebons（浮动的奖金）：如根据个人年度绩效评估结果和公司业绩结果，所发放的绩效奖金，这时发放比例和数额的差距就体现出来了。通常情况下发放规则是公开的，如某某级别的目标奖（即个人表现和公司表现均是达到目标时对应的奖金）相当于多少月的基本工资（而且级别越高的人奖金占总收入的比例越高），但对每个人具体的绩效评估结果各个企业的处理方法不一样，有的对全员公开，有的不。

第三、红包：通常是由老板决定的，没有固定的规则，可能取决于员工与老板的亲疏、取决于老板对员工的印象、取决于资历，取决于重大贡献等。通常不公开。民企多见。

亚商大多采取的是第二种方式variablebons（浮动的奖金），部分人员还可以得到红包的奖励。

《劳动法》第五十条

工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

《劳动合同法》第八十五条

用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：

（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；

（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；

（三）安排加班不支付加班费的；

（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。