(1)当实质性证据与形式化证据发生冲突时，应优先适用形式化证据来认定股东的资格。实质性证据不具有形式化证据的特征和证明功能，只是证明某个主体有出资行为，而实际出资并不当然取得股东资格，故只有在特定情形下才作为认定股东资格的证据。如实际出资者与在公司章程或股东名册上记载的股东不一致就股东资格发生争议时，应坚持以公司章程或股东名册记载为准确认股东资格。

(2)在对内关系，即股东资格的争议发生于公司与股东、股东与股东或股份出让人与受让人之间，也就是不存在第三人时，工商登记只具有对外公示的功能和证权的效力，应当以股东名册和公司章程记载为认定股东资格的依据；如果公司章程记载与股东名册记载的内容发生冲突，原则上应坚持公司章程优先适用的原则处理，因为公司章程为社团的自治性宪章，而股东名册只是经公司章程确认的股东资格的一种记载，是由公司章程派生而来的。

(3)在对外关系上，工商登记是对抗第三人最主要的证据。公司设立时，全体股东须共同签署公司章程并经工商登记，在设立登记中记载有股东名称或姓名的人可以对抗公司、其他股东和第三人而主张其具有股东资格。同样，善意第三人完全可以仅以工商登记来认定出资人或受让人的股东资格，而不考虑其他形式条件或实质条件。这主要是为了保护善意第三人，从而保护交易的安全。

一、股东虚假出资存在多种表现形式

(1)以无实际现金或实际现金不足的虚假银行进帐、对帐单骗取验资；

(2)以虚假的实物出资手续骗取验资；

(3)以实物、工业产权、非专利技术、土地使用权出资，但未办理财产转移手续；

(4)股东设立公司时，为了应对验资，将款项短期转入公司帐户后又立即转出，公司未实际使用该款进行经营。处理该类型的案件，法院通常要求股东或公司提供相关证据证明出资已经到位，若无法提供有关的证据，则认定为未实际出资。

实践中，股东在证明出资到位时，仅提供公司设立的验资证明是不够的，必须提供实际材料，如现实出资应提供银行的进帐单或其他资金证明，实物出资的应提供实物已实际过户的依据；如以房产、汽车等实物出资的，应将房产证和汽车等实物出资的应将房产证和汽车行驶证实际变更到公司名下。

法律依据：《中华人民共和国公司法》第二十八条股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户；以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。