根据财政部、国家税务总局《关于医疗、卫生机构有关税收政策的通知》（财税＜2000＞42号），对营利性医疗机构有关政策是：该机构取得的收入应按规定征收各种税收。为了支持营利性医疗机构自身的发展，对营利性医疗机构取得的收入，直接用于改善医疗卫生条件的，可自取得执业登记之日起，三年内给予以下优惠政策：对其取得的医疗收入免征营业税；对其自用的房产土地、车船，免征房产税、城镇土地使用税、车船使用税。

对非营利性医疗机构的政策是：

（1）按照国家规定取得的医疗收入免征各种税收，不按照国家规定价格取得的收入，不得享受这项政策。

（2）从事非医疗服务取得的收入，应按照规定征收各种税收。

（3）非营利性医疗机构将取得的医疗服务收入，直接用于改善医疗条件的部分，经税务部门批准，可抵扣其应纳税所得额，就其余额征收企业所得税；

（4）对非营利性医疗机构自用的房产、土地、车船免征房产税、城镇土地使用税、车船使用税。

一、营利性医疗机构与非营利性医疗机构的区别

1、经营目标不同营利性医疗机构运行的目标是追求利润最大化；非营利性医疗机构运行目标是为特定社会目标，不以赚钱为目的。

2、分配方式不同营利性医疗机构盈利后，投资者对税后利润可以分红，非营利性医疗机构不以赚钱为目的，但为了扩大医疗规模，也可适当盈利，但这种盈利只能用于自身发展，不能分红。

3、处置财产方式不同营利性医疗机构经营不善而终止服务，投资者个人可以自行处置其剩余财产；而非营利性医疗机构终止服务后，其剩余财产只能由社会管理部门或其他非营利性医疗机构处置。

4、收支结余的用途不同营利性医疗机构的收支结余是用于投资者回报。非营利性医疗机构的收支、结余不能用于投资者回报，也不能为其职工变相分配，所有利润和盈余只能投入到机构的再发展中，用于购买设备，引进技术，开展新的服务项目或向公民提供低成本的医疗卫生服务。

5、是否享受财产补贴政府办的县及县以上非营利性医疗机构，以定向补助为主，由同级财政安排。营利性医疗机构没有任何财政补助。

6、价格标准不同营利性医疗机构提供的医疗服务实行市场调节价，医疗机构根据实际服务成本或市场供求情况自主制订价格，非营利性医疗机构提供的医疗服务实行政府指导价，医疗机构按照主管部门制订的基准价，并在其浮动范围内，确定其本单位实际医疗服务价格。

法律依据：

《企业所得税法》

第七条

收入总额中的下列收入为不征税收入：

（一）财政拨款；

（二）依法收取并纳入财政管理的行政事业性收费、政府性基金；

（三）国务院规定的其他不征税收入。

第八条

企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。