这里要分情况而定。如果转让时双方签订了债务也一并转让的约定，并且债权人也同意债务转让的话，那么原企业的债务由转让后的企业承担；如果没有约定，那么需要清偿债务后再转让。这里最重要的，是“债权人同意”。公司合并分为吸收合并与新设合并两种方式，不管采用何种合并方式，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。有限责任公司分立的，分立前的债权债务一般由分立后的公司承担连带责任，公司不得以分立的方式逃避公司债务。由此可以看出，无论是转让还是合并，其债务关系都不会随之消失，而是转移到新的主体上。

一、公司合并后员工该怎么处理

公司合并后员工由存续的公司或者新设的公司接收，继续履行原劳动合同。

公司与员工自用工之日起建立劳动关系，订立书面劳动合同。公司发生合并或者分立等情况的，不影响合同的效力。

公司合并流程为：

1、通过股东会决议，与合并方订立书面的合并协议；

2、编制资产负债表及财产清单；

3、通知债权人并进行公告；

4、办理公司的合并登记。

债务的处理是由合并后的公司承担。公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。

二、公司合并的程序有哪些?

公司合并是指两个以上的公司依照法定程序，不需要经过清算程序，直接合并为一个公司的行为。1.合并程序(1)签订合并协议(2)编制资产负债表及财产清单(3)合并决议①有限责任公司的股东会对公司合并作出决议时，必须经代表2/3以上表决权的股东通过。②股份有限公司的股东大会对公司合并作出决议时，必须经出席会议的股东所持表决权的2/3以上通过。(4)通知债权人公司应当自作出合并决议之日起10日内通知债权人，并于30日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起30日内，未接到通知书的自公告之日起45日内可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。(5)依法进行登记2.合并各方债权债务的承接(1)公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后继续存续的公司或者新设立的公司承继。(2)司法解释(2010年新增)①企业进行吸收合并时，公告通知了债权人，企业吸收合并后，债权人就被合并企业原资产管理人(出资人)隐瞒或遗漏的企业债务起诉合并方的，如债权人在公告期内申报过该笔债权，合并方在承担民事责任后，可再行向被合并企业原资产管理人(出资人)追偿，如债权人在公告期内未申报过该笔债权，则合并方不承担民事责任。②企业吸收合并或新设合并后，被合并企业应当办理而未办理工商注销登记，债权人起诉被合并企业的，法院应根据企业合并后的具体情况，告知债权人追加责任主体，并判令责任主体承担民事责任。