医疗事故赔偿申请的流程如下：

1、准备申请材料：索赔申请书、个人身份证、病历本，就诊资料、住院资料等；

2、争议处理机关按条例规定对患者的申请进行审查，决定是否受理；

3、争议处理机关将受理决定书面通知申请人，不予受理的，书面通知申请人，并说明理由；

4、自作出受理决定之日起5日内，将有关材料移交市医学会组织首次鉴定，并书面通知申请人；

5、由市医学会按条例规定组织专家进行鉴定，市卫生局对鉴定的人员资格和专业类别、鉴定程序进行审核；

6、经鉴定，已确定为医疗事故的，双方当事人共同申请，签署调解委托书，按自愿原则和条例规定，就赔偿进行调解。

一、医疗事故鉴定要注意什么？

1、需要注意以下事项：

1)涉及死因、伤残等级鉴定的，并应当从专家库中随机抽取法医参加专家鉴定组；

2)专家鉴定组成员有下列情形之一的，当事人应当申请其回避：

①是医疗事故争议当事人或者当事人的近亲属的；

②与医疗事故争议有利害关系的；

③与医疗事故争议当事人有其他关系，可能影响公正鉴定的。

3)一方当事人可以有几人参加鉴定。

不超过3人，律师可以作为代理人参加鉴定。

4)书面陈述意见的主要内容。

2、经鉴定属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由医疗事故处理申请的一方当事人支付。

鉴定申请有时效期，当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。

卫生行政部门应当自收到医疗事故争议处理申请之日起10日内进行审查，作出是否受理的决定。予以受理后，应当自作出受理决定之日起5日内将有关材料交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定，并书面通知申请人。

而医学会应当在受理医疗事故技术鉴定之日起5日内通知双方当事人提交所需材料，当事人应当自收到医学会的通知之日起10日内提交有关医疗事故技术鉴定的材料书面陈述及答辩。医学会在收到上述材料及答辩之日起45日内组织鉴定并出具医疗事故技术鉴定书。

二、医疗事故处理流程是怎样的？

1、发生医疗事故争议，医患任何一方都有权向当地卫生行政部门申请医疗事故鉴定，填写申请表格，或医患双方共同向医学会申请鉴定。

2、县级卫生行政部门负责调解及协助医患双方向医学会提出医疗事故鉴定申请。当医疗事故争议调解不成功，患者家属可以在知道医疗争议之日起一年内向市医学会提出医学鉴定，或者直接向市人民法院提起诉讼。

3、卫生行政部门接到申请书10个工作日内作出是否受理的决定，并书面通知申请人。

4、患者死亡，医患双方不能确定死因或者对死因有异议的，应当在患者死亡后48小时内进行尸检；具备尸体冻存条件的，可以延长至7日。尸检应当经死者近亲属同意并签字。尸检由按照国家有关规定取得相应资格的机构和病理解剖专业技术人员进行。尸检应由提出异议一方交纳尸体检验费。医疗单位或者病员家属拒绝进行尸检，或者拖延尸检时间超过四十八小时，影响对死因的判定的，由拒绝或拖延的一方负责。

5、县级卫生行政部门对受理的医疗事故鉴定申请，5个工作日内移交给市医学会。

6、按有关规定，提出要求鉴定的一方，应先向市医学会交纳医疗事故争议鉴定费。若鉴定结果为医疗事故，则该鉴定费由医疗机构支付；若鉴定结果不是医疗事故，则该鉴定费由提出鉴定方支付。

7、市医学会组织专家进行医疗事故争议鉴定。

8、县级卫生行政部门将鉴定结论送达申请人及另一方当事人。