1、由监狱管理机关执行。刑法规定剥夺政治权利的效力，当然施用于主刑执行期间。犯罪分子被判处有期徒刑、无期徒刑、死刑缓期二年执行，在判决生效后，即送往监狱接受教育改造和强制劳动改造，在主刑执行期间，监狱管理机关依照刑法的规定，施行对其剥夺政治权利的处罚，如果罪犯在主刑还未执行之时，其剥夺政治权利的判决已执行完毕，就失去了对罪犯剥夺政治权利的惩罚、教育、警戒作用。

2、由公安机关执行。被判处管制拘役的罪犯，是交由公安机关执行其主刑的，其附加剥夺政治权利，也应由公安机关执行。刑法规定附加剥夺政治权利的，从主刑执行完毕或者假释之日起执行附加政治权利。刑事诉讼法规定，对于被判处剥夺政治权利的罪犯，由公安机关执行。监狱在主刑执行完毕或者罪犯假释时，应将其剥夺政治权利的起止期限在释放证或者假释证上注明连同人民法院的判决书一并转交其居住地公安机关，公安机关应当在其居住地公布，待其执行完毕时应当宣布，恢复其应享有的政治权利。

哪些犯罪单独适用剥夺政治权利

1、危害国家安全罪中的分裂国家罪，煽动分裂国家罪，武装叛乱或者武装暴乱罪，煽动颠覆政权罪，资助罪。

2、侵犯公民人身权利、民主权利罪中的非法剥夺他人人身自由罪，侮辱、诽谤罪，煽动民族仇恨、民族歧视罪，破坏选举罪。

3、妨害社会管理秩序罪中的妨害公务罪，聚众扰乱社会秩序罪，招摇撞骗罪，伪造、变造或者盗窃、抢夺、毁灭国家机关的公文、证件、印章罪，伪造公司、企业、事业单位，人民团体的印章罪，伪造、变造居民身份证罪，聚众“打砸抢”罪，扰乱社会秩序罪，聚众扰乱公共场所秩序、交通秩序罪，组织黑社会性质组织罪，非法集会、游行、示威罪，非法携带武器、管制刀具或者爆炸物参加集会、游行、示威罪，破坏依法举行的集会、游行、示威罪，侮辱国旗、国徽罪。

4、危害国防利益罪中的聚众扰乱军事禁区、军事管理区罪，伪造、变造、买卖或者盗窃、抢夺武装部队公文、证件、印章罪。

5、渎职罪中的泄露国家秘密罪，司法工作人员徇私枉法罪。刑法分则条文中没有规定剥夺政治权利的犯罪，不得独立适用剥夺政治权利。