公司的股东变更，在税务机关部门也要进行变更手续。根据我国的法律规定，纳税人税务登记的内容，如果发生了变化，是需要及时向税务机关部门，进行变更内容的登记处理。首先纳税人要去税务机关部门，填写登记变更申请表，同时提供相关的手续资料。税务机关部门，经过审查之后，如果申请变更的事项符合法律的相关规定的情况的时候，税务机关就会受理此变更事项。如果当事人的手续存在问题，税务机关部门会告知当事人进行改正。关于变更之后的税务证件，如果纳税人对于税务登记证中的内容，以及税务登记表里面的内容，都进行了变更，这个时候，税务机关部门就会重新为纳税人，核发新的税务登记证件。也就是说原来的税务登记证就不能在使用了。如果纳税人仅仅是对税务登记表里面的内容进行更改的，原来的税务登记证里面的内容不做变更，这个时候税务机关部门就不会对纳税人核发新的税务登记证件了。在税务机关部门办理税务变更事项的时候，需要向书屋机关部门递交一些手续资料，那么这些手续资料又包括什么呢?首先，如果纳税人是需要在工商局，对相关的证件进行变更处理的时候，这个时候需要向工商管理部门提供一些相关的资料。在工商管理部门做出变更登记的处理的时候，纳税人应该在三十天之内的时间里面，对工商管理部门提供所需的资料，原来的营业执照以及税务登记证正本、税务登记证副本以及税务登记表，其它的一些相关资料，这些都需要提供给工商管理部门。如果纳税人进行的变更内容，与工商管理部门没有关系，就恶意直接持相关的资料去税务登记机关办理变更了。在税务机关批准对相关内容进行变更开始，在三十天的时间里面，纳税人要将原税务登记证正本、税务登记证副本以及税务登记表，提供给税务机关部门，其它的相关资料可以咨询税务机关进行准备。以上就是公司股东发生变化时，作为纳税人应该在税务机关部门，进行变更手续的处理程序。总结起来就是，如果在工商部门需要做相应的变更的时候，应该要先去工商部门进行变更手续的处理，然后再去税务机关部门进行变更。如果在工商部门不需要进行变更，就直接持相关的资料去税务登记部门办理即可。