一、国家安全机关立案侦查的案件是什么?

涉及到国家安全，国家机密，叛国，国家高层领导人的问题由国家安全部门侦查。《中华人民共和国国家安全法》第十五条国家坚持中国共产党的领导，维护中国特色社会主义制度，发展社会主义民主政治，健全社会主义法治，强化权力运行制约和监督机制，保障人民当家作主的各项权利。国家防范、制止和依法惩治任何叛国、分裂国家、煽动叛乱、颠覆或者煽动颠覆人民民主专政政权的行为;防范、制止和依法惩治窃取。

中国的国家安全工作原统由公安机关负责。1988年6月第六届全国人民代表大会第一次会议决定，专门设立中华人民共和国国家安全部，主管原有公安机关承担的间谍、特务案件的侦查工作，是国家公安机关性质，属于国务院的组织领导体系。

国家安全机关与公安机关的分工是：前者主要是对外，后者主要是对内，互相结合，组成一个完整的保卫国家安全和社会治安的安全体系。国家安全机关可以行使宪法和法律规定的公安机关的侦查、拘留和执行逮捕的职权。

二、哪些案件人民检察院可以直接立案?

依据相关法律的规定，人民检察院立案管辖的案件一般是属于国家机关工作人员贪污、受贿等职务犯罪的案件。

《人民检察院刑事诉讼规则》

第八条人民检察院立案侦查贪污贿赂犯罪、国家工作人员的渎职犯罪、国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪案件。

贪污贿赂犯罪是指刑法分则第八章规定的贪污贿赂犯罪及其他章中明确规定依照第八章相关条文定罪处罚的犯罪案件。

国家工作人员的渎职犯罪是指刑法分则第九章规定的渎职犯罪案件。

国家机关工作人员利用职权实施的侵犯公民人身权利和民主权利的犯罪案件包括:

(一)非法拘禁案(刑法第二百三十八条);

(二)非法搜查案(刑法第二百四十五条);

(三)刑讯逼供案(刑法第二百四十七条);

(四)暴力取证案(刑法第二百四十七条);

(五)虐待被监管人案(刑法第二百四十八条);

(六)报复陷害案(刑法第二百五十四条);

(七)破坏选举案(刑法第二百五十六条)。

第九条国家机关工作人员利用职权实施的其他重大犯罪案件,需要由人民检察院直接受理的时候,经省级以上人民检察院决定,可以由人民检察院立案侦查。

国家安全机关其实是一个相对比较神秘的司法机关，因为国家安全局的工作性质非常的特殊，所以该部门的很多重要信息不能过多的向社会民众透露。而且，在国家安全机关工作的这些工作人员的身份也是对外保密的，由国家安全机关立案侦查的案件普通的刑事案件有很大的区别。