中秘自贸协定于2010年3月1日生效。为配合中秘自贸区的实施，海关总署制定发布了《中华人民共和国海关进出口货物原产地管理办法》（以下简称《办法》），《办法》与《中秘自由贸易协定》同时实施，对中秘自贸区进出口货物原产地规则和管理程序作了详细规定，包括原产地规则、直达运输规则、货物进出口海关监管等，原产地证书、签证手续、原产地核查等。中秘自贸协定项下的所有进出口货物均适用本办法。也就是说，《办法》不仅适用于中国从秘鲁进口商品的原产地控制，但也适用于我国对秘鲁出口商品的原产地控制

原产地认定

办法明确了确定进口商品原产地为秘鲁的三个标准：

完全取得，即完全取得或在秘鲁生产。根据《办法》，适用本标准的货物包括在秘鲁出生和饲养的活动物、在秘鲁收获或采集的植物产品和从秘鲁提取的矿物

如果所有原产于中国或秘鲁的材料都在秘鲁使用，则可能存在非秘鲁的要素投入（如电力、石油、石油、天然气等），但所有采用中国或秘鲁原产材料生产的货物仍应视为秘鲁原产货物，使用非中国或秘鲁原产材料的前提是，这些材料在秘鲁加工后制成的产品必须符合税种变更的要求，中秘自贸协定《办法》附件一产品特定原产地标准表中相应税目下的地区价值构成及处理程序为基于协调制度6位编码的原产地标准表。对于使用非秘鲁原产材料生产的任何货物，应根据上述第二类和第三类货物标准表中税目对应的原产地标准确定货物的原产地，符合本办法第七条累积规则和第八条小含量规定的货物，仍视为原产秘鲁的货物。

本办法规定了确定货物原产地的补充规则。例如，哪些工艺或处理被视为微工艺或处理而不能被授予原产地资格？如何确定一整套货物的原产地？运输和零售用包装材料和容器对确定货物原产地有何影响？生产商品所使用的配件、备件、工具和中性元件对商品原产地有何影响？如何区分可互换材料等

此外，《办法》还根据《办法》的规定，对展品适用协议税率的条件作了专门规定

直达运输规则，符合直接运输要求的有两种情况：

货物从秘鲁直接运输到中国，不经过其他国家或地区

货物已经通过其他国家或地区转运，但同时满足三个条件：未进入转运地进行贸易和消费；除装卸、重新包装或者其他必要的处理以外，未进行其他处理，使货物处于良好状态的；在转运地停留不超过3个月

为证明货物符合上述条件，进口商必须提交相应的单证，包括联运提单，转船地海关出具的证明文件（转船时必须提供）或者符合进口地海关要求的其他证明文件。根据海关规定，如果进口商无法提交集装箱运输货物的转运地证明，海关可以通过对货物的检验确认货物符合直达运输规则，转运地证明可以免除海关手续，货物申报进口时，进口货物的收货人应当按照海关规定先填写报关单，同时提交秘鲁授权机构出具的有效原产地证书或原产地声明原件（适用于总值不超过600美元的货物）。此外，如果进口商不能提交原产地证书或原产地声明，但货物原产于秘鲁，必须申报才能享受协定税率，则应提交上述商业发票、装箱单和其他相关运输单据原件，则进口商应按本办法附件4规定的格式提交原产地资格声明作为补充声明

因此，进口商在申报货物原产地资格时，必须提交三份文件之一，即原产地证书，原产地声明和原产地资格声明。进口商向海关申报时未提交上述三种单证之一的，即使在清关后提交原产地证书，货物也不会享受商定的税率

对原产地证书的要求主要包括安全特征（签证官签名、组织印章、，等）与秘鲁通知中国海关的备案资料一致，所列货物为同批货物等，证书有效期一年，可补发。被盗、遗失、毁损的，可以出具出口报关单副本。

本办法规定出口货物报关的，出口商应当按照报关规定填写报关单，并向海关提交《中秘自由贸易协定》原产地证书电子数据或原产地证书原件复印件。从《中华人民共和国海关亚太贸易协定进出口货物原产地管理办法》开始，为加强自贸区出口货物的原产地管理，按照《条例》的规定，将海关颁布的原产地管理办法和规定全部纳入本规定办法，对已申报原产地资格的上述货物，海关可先按一般进口货物的应纳税额计提保证金，进口商可以自缴纳押金之日起3个月内向海关提交有效的原产地证书或者原产地声明等海关要求的单证，申请退还押金。经海关批准，可以延长保管期限，但最长不得超过一年。有关货物在进口时已按一般贸易货物征税的，可以按照《中华人民共和国进出口关税条例》的有关规定，自纳税之日起一年内向海关申请退税，在符合上述规定的前提下

其他规定《原产地标志管理办法》规定，在中秘自贸协定进出口货物及其包装上标注原产地标志的，原产地标志应当与按照《办法》确定的货物原产地一致。《原产地核查办法》规定了海关对进口货物开始核查的条件和四种核查方法。海关可以要求进口货物的收发货人、出口商或者生产商以及秘鲁主管部门提供资料或者协助核查，也可以进行跨境实地核查