公司收购股权转让中的法律风险，对此并并没有法律规定。实践中，可能存在的法律风险如下：1、收购的股权存在瑕疵；2、转让的价款可能未按照协议约定支付；3、存在股权置换或者交叉持股。《上市公司收购管理办法》第五十五条第一款、第二款规定，收购报告书公告后，相关当事人应当按照证券交易所和证券登记结算机构的业务规则，在证券交易所就本次股份转让予以确认后，凭全部转让款项存放于双方认可的银行账户的证明，向证券登记结算机构申请解除拟协议转让股票的临时保管，并办理过户登记手续。收购人未按规定履行报告、公告义务，或者未按规定提出申请的，证券交易所和证券登记结算机构不予办理股份转让和过户登记手续。

如何规避公司股权转让合同的风险

1、主体资格风险。作为主体资格的尽职调查，主要通过考察目标公司的营业执照、公司章程等注册文件来了解；同时还要查证是否有批准文件，批准和授权的内容是否明确、肯定，内容对此次并购可能造成影响。

2、财产和财产权利风险。土地与房产的价值主要查看产权证和土地使用权证，其权利状况决定了土地和房产的价值，机器设备要查看其原始采购凭证，扣除适当折旧后，评估其净值，对于通过融资租赁形式获取的机械设备，在未付清全款之前，所有权都不归公司所有。

3、债权债务风险。相关的收购风险表现为：目标公司的金额较大的应收、应付款和其他应收、应付款情况，其是否合法有效，债权有无无法实现的风险；目标公司将要履行、正在履行以及虽已履行但可能存在潜在纠纷的重大合同的合法性、有效性，是否存在潜在风险；目标公司对外担保情况，是否有代为清偿的风险以及代为清偿后的追债风险；目标公司是否有因环境保护、知识产权、产品质量、劳动安全、人身权等原因产生的侵权之债。

《上市公司收购管理办法》第五十五条第一款、第二款收购报告书公告后，相关当事人应当按照证券交易所和证券登记结算机构的业务规则，在证券交易所就本次股份转让予以确认后，凭全部转让款项存放于双方认可的银行账户的证明，向证券登记结算机构申请解除拟协议转让股票的临时保管，并办理过户登记手续。收购人未按规定履行报告、公告义务，或者未按规定提出申请的，证券交易所和证券登记结算机构不予办理股份转让和过户登记手续。