配偶失踪两年后不可以自动解除婚姻。夫妻中的一方被宣告为失踪人后，另一方再向人民法院提起离婚诉讼，法院会判决离婚，婚姻关系才会被解除。诉讼离婚是指夫妻双方就是否离婚或者财产的分割、债务的分担、子女的抚养等问题无法达成一致的意见，向人民法院起诉，通过调解或判决解除婚姻关系的离婚制度。

婚姻一方因配偶失踪要求离婚，登记机关是否受理：

婚姻当事人一方因配偶失踪，生死不明，造成婚姻关系名存实亡的，婚姻当事人申请离婚的，应当由人民法院办理，婚姻登记机关不能受理。因为，婚姻登记机关受理的是男女双方自愿的离婚，一方当事人失踪的，婚姻登记机关无法审查双方当事人是否属于自愿离婚，对这类离婚申请，婚姻登记机关不予受理。

婚姻当事人可以向人民法院申请宣告失踪人死亡，一方被宣告死亡的，其婚姻关系自行终止。宣告死亡的判决，从人民法院宣告之日起生效。因此，自宣告死亡判决当日起，当事人双方的婚姻关系终止，生存一方即可再婚。但由于宣告死亡只是法律上推定死亡，下落不明人不一定真正死亡。因此，被宣告死亡人重新出现时，本人或者利害关系人可以向人民法院提出申请撤销死亡判定。人民法院应当作出新判定，撤销原判定。如果宣告死亡人的配偶尚未再婚，其婚姻关系从撤销死亡宣告之日起自行恢复。如果其配偶已经再婚或者再婚后又离婚，以及再婚后配偶已死亡的，则不认定其夫妻自行恢复。如果要恢复夫妻关系，则应当通过法定登记程序再行结婚。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。