1、主体和客体不同。

股权收购的主体是收购公司和目标公司的股东，客体是目标公司的股权。资产收购的主体是收购公司和目标公司，客体是目标公司的资产。

2、两者的负债风险不同。

股权收购后，收购公司成为目标公司控股股东，收购公司仅在出资范围内承担责任，目标公司的原有债务仍然由目标公司承担，但因为目标公司的原有债务对今后股东的收益有着巨大的影响，因此在股权收购前，收购公司必须调查清楚目标公司的债务状况。对于目标公司的或有债务在收购时往往难以预料，因此，股权收购存在一定的负债风险。而在资产收购中，资产的债权债务情况一般比较清晰，除了一些法定责任，如环境保护、职工安置外，基本不存在或有负债的问题。因此资产收购关注的是资产本身的债权债务情况。

3、两者还存在税收方面的差异。

在股权收购中，纳税义务人是收购公司和目标公司的股东，而与目标公司无关。除了合同印花税，目标公司股东可能因股权转让所得缴纳所得税。资产收购中，纳税义务人是收购公司和目标公司。

一、公司收购手续

公司收购时应当按照收购流程来进行，避免后续发生牵扯不清的债权债务纠纷，公司收购一般具有以下流程：一、收购意向的确定二、收购方作出收购决议在收购基本意向达成后，双方必须为收购工作做妥善安排。收购方如果为公司，需要就股权收购召开股东大会并形成决议，如果收购的权限由公司董事会行使，那么应由董事会行使收购决议，决议是公司作为收购方开展收购行为的基础文件。三、目标公司召开股东大会，其它股东放弃优先购买权股权收购实质上是目标公司股东对外转让股权的行为，《公司法》规定，股东转让股权必须经过公司持表决权股东过半数同意，其它股东对转让的股权在同等条件下有优先购买权。那么要顺利完成收购，目标公司的股东必须就上述事项召开股东大会并形成决议，明确同意转让并放弃优先购买权。四、对目标公司开展尽职调查，明确要收购对象的基本情况五、签订收购协议在前述工作的基础上，双方就收购问题最终达成一致意见并签署收购协议，收购协议的拟订与签署是收购工作中最为核心的环节。