农村房屋用地使用权包括的内容有：

1、占有权。房屋用地使用权人经依法申请批准取得房屋用地使用权，便享有对房屋用地的独占权，任何组织个人不得非法侵占、擅自使用或剥夺其房屋用地的使用。

对于房屋用地上旧有的建筑设施及其他林木，所有人或管理人应在合理期限内做出处理，不得影响房屋用地使用权人的使用。

2、使用权。房屋用地使用权没有明确的时间限制。

不论房屋用地使用的年限长短及其建设情况如何，房屋用地使用权非依法定原因不能被剥夺。对于房屋用地上的建房，与房屋用地使用权同时受法律的长期保障，房屋用地使用权人可以自由形式权利。

3、在房屋用地空闲处修建其他建筑物、设施的权利，但注意不能修建违章建筑。房屋用地使用权人在主要住宅建筑外，可自行在房屋用地范围内建筑其他生产或生活需要的建筑和设施。

4、房屋用地使用权人有在房屋用地内种植林木、花草、蔬菜的权利。

5、依法附随房屋出让房屋用地使用权的权利。国家保护私有房屋合法买卖，继承、赠与等权利。

因房屋和房屋用地连同一体，不可分离，所以，房屋用地使用权必须连同房屋一并转移。房屋所有权的变动，必须报请县级人民政府房屋管理部门进行变更登记。

集体建设用地使用权流转管理

《国务院关于深化改革严格土地管理的决定》规定：在符合规划的前提下，村庄、集镇、建制镇中的农民集体所有建设用地使用权可以依法流转。

《国务院办公厅关于严格执行有关农村集体建设用地法律和政策的通知》也进一步明确：严格控制农民集体所有建设用地使用权流转范围。农民集体所有的土地使用权不得出让、转让或者出租用于非农业建设。符合土地利用总体规划并依法取得建设用地的企业发生破产、兼并等情形时，所涉及的农民集体所有建设用地使用权方可依法转移。其他农民集体所有建设用地使用权流转，必须是符合规划、依法取得的建设用地，并不得用于商品住宅开发。

《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四条，农民集体所有的土地；

由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门内提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。