一、合伙企业转让股权怎么缴税

《财政部、国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》规定，合伙企业生产经营所得和其他所得采取先分后税的原则纳税。我国《合伙企业法》规定，合伙企业的生产经营所得和其他所得，按照国家有关税收规定，由合伙人分别缴纳所得税。合伙人的出资、以合伙企业名义取得的收益和依法取得的其他财产，均为合伙企业的财产。

根据上述规定，甲企业需将该项股权转让所得并入生产经营所得和其他所得扣除相关成本费用后的净所得，由投资者分别缴纳所得税。

该项股权投资是以合伙企业的名义出资的，根据《财政部、国家税务总局关于印发关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定的通知》，合伙企业的收入总额包括商品（产品）销售收入、营运收入、劳务服务收入、工程价款收入、财产出租或转让收入、利息收入、其他业务收入和营业外收入。同时，财税文件规定，生产经营所得和其他所得，包括合伙企业分配给所有合伙人的所得和企业当年留存的所得（利润）。

财税规定自然人投资者在取得该项股权转让收益时，应作为投资者的生产经营所得，比照《个人所得税法》中规定的个体工商户的生产经营所得应税项目，适用5％～35％的五级超额累进税率，计算缴纳个人所得税。本年度应纳所得税额为（2000－1000）×35％－0.675＝349.325（万元）（暂不考虑该投资者可税前扣除的其他费用）。

如果该项投资是以自然人投资者个人的名义出资的，取得该项股权转让收益则不属于该合伙企业的收益，需要按照《个人所得法》中规定的财产转让所得适用20％的税率，计算缴纳个人所得税。本年度应纳所得税额为（2000－1000）×20％＝200（万元）（暂不考虑可税前扣除的相关合理费用）。

二、如何认定股权转让的价格

股权转让价格的认定不能一概而论，应从以下几方面事实作为依据：

一是以股权的真实价值为依据。股权的真实价值，即股权所对应的公司资产的价值。

一般情况下，有限责任公司全部股权的价值应等同于公司整体资产的价值，而公司的资产从某种意义上而言，实际是由公司的全部股权所构成。故股权转让实质上是对公司资产的转让，按照等价的交易原则，其转让价格应等同于被转让股权所对应的公司资产的价值，这是确定股权转让价格最常用的依据。需要注意的是，由于股权具有财产权和社员权的双重属性，故股权中所包含的某些权利如分红权、资产分配权等，虽然与股东的经济利益有一定关系，但其权利的基础是股东的成员身份，故其权利价值无法以货币方式来衡量，在各方当事人没有相应约定的情况下，上述权利不应计入股权转让的价值范围。

二是以当事人的真实意思表示为依据。

在某些情况下，股权转让的价格可能与其真实价值不符，由于各种各样的原因，股权转让的当事人可能脱离股权的真实价值而另行确定股权的转让价格。根据自愿平等的合同原则，当事人自行确定转让价格是其享有的民事权利，故在没有无效和可撤销事由的情况下，即使转让各方当事人约定的股权转让价格与股权真实价值不符，只要此种约定是其真实意思表示，亦可以作为认定股权转让价格的依据。

三是以工商登记材料的记载为依据。

工商登记作为企业内部状况对外公示的主要手段，其法律效力应得到足够的尊重，工商登记材料中所记载的股东持股状况、出资数额和股权价值是公司债权人向公司和股东主张权利的重要依据，也是股东承担相应民事责任的原因之一。考虑到受让股权后，新股东可能会产生对外承担相应民事责任的风险，而此类风险的大小则基本按照工商登记材料的记载予以确定。因此，从保护债权人权益的角度出发，工商登记材料中所记载的股权转让价格，也应当成为重要依据。

四是以合法有效的合同为依据。

在审判实践中，还可能发生当事人签订的多份股权转让合同中，有某些合同应属无效的情况。此时即使无效合同系当事人的真实意思表示，亦不能以此作为认定股权转让价格的依据，否则即有鼓励和纵容当事人违法的嫌疑。在此情况下，应当在考虑有效合同是否反映了股权的真实价值，是否亦系当事人真实意思表示的基础上，以合法有效的合同作为确认股权转让价格的依据。当然，如有效合同确实无法作为确认股权转让价格的依据，则应当按照实际情况，由法院启动评估程序确定股权转让价格。

三、股权转让协议是否公证才有效

根据有关规定，签订股权转让协议属于一项民事法律行为，只要双方主体合格，意思表示真实，且按照该公司章程的规定征求了其他股东是否购买的意见，其他股东放弃了优先购买权情况下，签订的股权转让协议，自双方签字之日起生效，不需要公证。公证不是股权转让协议生效的必要条件。

公证是由第三方即公证处进一步证明该协议的真实性、合法性，是第三方对于民事法律行为的一种证明，该证明不影响民事法律行为本身的有效或无效。依据规定股权转让合同是否办理公证，取决于当事人的意思自治，在双方未明确约定将公证作为股权转让协议生效的条件时，股权转让协议自双方签字之日起生效（法人股之间股权转让需要盖公章）。