中小股东的利益保护的方法如下：

1、中小股东可以通过单独或者联合行使召集和主持股东会会议的权利，以维护自己的合法权益；

2、中小股东有权依法转让自己的股权；

3、股权优先购买权，这是所有股东享有的一项特权。

一、合伙开店一年怎么退股

股权转让一般要求原有股东或者第三人受让股份。依照原公司法，有限责任公司的股东是不能请求公司回购自己所持有的股份的。公司资本的原则资本法定、资本维持、资本不变，要求公司在存续的期间，应当保持与资本额相当的财产。公司资本确定后不能随意改变。允许公司回购股东的股份，将会影响公司资本的充实率。按照资本多数的原则，股权的行使按照所持的股份多少来确定表决权。大股东可能会通过对董事会、监事会、经理等控制公司权利，禁止公司回购股东持有的公司股权，可能会对中小股东的权益造成损害。为了实现公司法保护小股东的价值目标，维护小股东的利益，新公司法规定了有限责任公司的股权回购制度。新公司法规定三种情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权。第一，公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；第二、公司合并、分立、转让主要财产的；第三、公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。

二、股东权的权利怎样分类

股东权利的分类如下：

1、根据权利行使的目的，可自益权和共益权。自利权是指股东为自身利益行使的权利，如发给股票或其他股权证明请求权、股份转让权、股息分配请求权、公司剩余财产分配请求权等。共同利益是指股东为自身利益和公司利益行使的权利。如出席股东大会并投票，请求法院宣布股东大会决议无效，请求召集股东临时会议或自行召集；

2、根据权利主体的不同，可分为普通股东权和特别股股东权。前者是指一般股东享有的权利，后者是专属特别股股东享有的权利。特别股股东权利的范围、行使顺序、金额、优惠待遇限制一般在公司章程中规定。我国公司法对此没有规定；

3、根据权利的性质，可分为固有权和非固有权。前者是指根据公司法规定不得剥夺章程或者股东会议的权利，如特别权和共益权，后者是指可以根据公司章程或者股东会议剥夺的权利，自益权多为此类权利。

三、股东优先购买权的行使条件有哪些

1、股东优先权的行使是基于公司股东转让其股权而产生，但并非所有股东转让的股权都当然享有优先权。

首先，公司的章程没有对股东“对外”转让股权加以禁止；

其次，只有股东“对外”转让股权时，其他股东才具备主张优先购买权的前提；如果股东仅是将股权转让给公司内部的其他股东，则对该股权转让，其他股东无权行使优先权。

再次，股权转让除了协议转让方式外，还有可能因继承、赠与等非交易行为发生股权变动，在此等情形之下，其他股东同样不能行使股东优先购买权。

2、股东优先购买权针对的是公司股权而不是公司资产。

股东优先购买权所对应转让的是股东所持有的公司股权，其处置主体是股东，其权利基础是股东对其所持股权的处置权。

公司资产的处置主体是公司，公司资产的处置根据公司章程或股东会决议确定的规则进行。

因此，股东优先购买权针对的是公司股权而不是公司资产。

3、拟受让股权的股东未明确放弃优先购买权。

股东优先购买权是法律和公司章程赋予股东的一项权利，一旦股东明确表示放弃该权利，该权利即告终止，股东不得再行主张。故此，股东在对是否放弃优先购买权进行表态时应予慎重。