在国税与地税合并之前，企业所得税一般按企业性质来确认对应的管辖机构，如果是缴纳增值税的企业，一般企业所得税也在国税，如果是缴纳营业税的企业，比如建筑行业，服务行业等，企业所得税也在地税。在国税地税合并之后，都是由税务总局管理。

有机肥企业所得税减免吗

《中华人民共和国企业所得税法》第二十七条第三款规定：企业从事符合条件的环境保护、节能节水项目的所得，可以免征、减征企业所得税。《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第八十八条规定：企业所得税法第二十七条第（三）项所称符合条件的环境保护、节能节水项目，包括公共污水处理、公共垃圾处理、沼气综合开发利用、节能减排技术改造、海水淡化等。项目的具体条件和范围由国务院财政、税务主管部门商国务院有关部门制订，报国务院批准后公布施行。企业从事前款规定的符合条件的环境保护、节能节水项目的所得，自项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第三年免征企业所得税，第四年至第六年减半征收企业所得税．

根据《财政部、国家税务总局关于有机肥32313133353236313431303231363533e4b893e5b19e31333361326264产品免征增值税的通知》（财税〔2008〕56号）规定，自2008年6月1日起，纳税人生产销售和批发、零售有机肥产品免征增值税。享受上述免税政策的有机肥产品是指有机肥料、有机——无机复混肥料和生物有机肥。有机肥料，指来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为主要功能的含碳物料。有机——无机复混肥料，指由有机和无机肥料混合和（或）化合制成的含有一定量有机肥料的复混肥料。生物有机肥，指特定功能微生物与主要以动植物残体（如禽畜粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。

《中华人民共和国企业所得税法》

第一条在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织（以下统称企业）为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。个人独资企业、合伙企业不适用本法。

第四条企业所得税的税率为25％。非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得，适用税率为20％。