1、由于就业主体的复杂性，很难确定被告人的主体资格p>近年来，在建筑工程领域拖欠农民工工资的案件中，有80%以上涉及非法分包、挂靠工程。”“分包”、“分包”和个人挂靠已成为建筑工程领域的普遍现象。由于承包人违法分包、转包、挂靠建设工程，劳动关系趋于复杂。一旦农民工讨薪，各级承包商纷纷拿出分包合同，相互推卸责任，谁也不愿承担责任。具体来说，有以下几种情况。首先，许多合格的建筑承包商将全部或部分工程分包给所谓的“项目经理”，而“项目经理”又将工程分包给其他承包商。二是一些专业化的劳务分包，让承包人自己找工人，造成大量不符合《劳动法》和《建筑法》规定的不合格用人单位进入建筑市场。第三，一些个人借用其他单位的资质，实际施工纯属个人行为。第四，一些承包商在施工期间有住所和管理人员，但工程完工后，管理人员离开施工现场，组织人员离开。一些施工单位甚至在原单位取消或合并后在异地新设公司，在施工完成后通过有关部门在较短时间内完成。结果，农民工自己搞不清自己在为哪个“老板”打工，甚至农民工也搞不清自己的转包。第五，施工单位很少签订书面劳动用工协议。即使签署了一些协议，但盖章和签字等许多程序都不完整。更有甚者，用人主体弄虚作假，在工商部门找不到协议中所签单位的名称。由于上述原因，农民工作为劳动者，无法区分责任主体。法院在审理此类案件时，要花费大量精力寻找和确定就业主体，确定被告人的主体资格。有时，一个案件需要多次增加或变更诉讼主体

其次，由于用工程序不完善，农民工难以提供证据。在劳动争议诉讼中，由于在劳动报酬方面缺乏相关的书面协议或劳动合同，在劳动报酬的支付标准、支付方式、期限、数量标准等方面缺乏相关的书面依据，许多原告在求权上处于被动状态。其次，农民工的工作时间主要由承包商记录。承包人或者发包人计算工程量，并制作会计报表。劳动者自身在履行劳动合同的全过程中处于被动和弱势地位。三是法院难以查证。部分农民工诉讼当事人只有诉求，没有相关证据，无法提供相关线索。双方各执一词，法院不能及时查明事实的；有的情况下，检方自行取证时间过长或经多个部门处理无效。造成证据丢失、证人难寻、证言失真，增加了法院查证的难度；三是用人单位故意回避，造成调解和快速结案的困难p>拖欠农民工工资的企业多为经济实力较弱的小企业、个体经营户和未经工商登记的小作坊、加工场所，主要集中在劳动密集型、规模较小的行业，实力弱，技术水平低，抗风险能力弱，破产风险高。一旦遇到经营困难，拖欠大量职工工资，一些小企业主故意回避，致使法院无法直接交付，给农民工带来了很大的麻烦

第四，群体性事件难以解决p>由于拖欠农民工工资案件涉案人员多，一旦处理不当，很容易造成农民工上门讨薪、上访闹事，甚至采取极端手段达到目的，从而直接影响社会稳定。群众信访事件一旦引起，解决起来就非常困难。在很多情况下，政府需要先交钱清理拖欠工资事件才能得到妥善解决