个人所得税专项扣除不是扣除工资。专项附加扣除是指在计算综合所得应纳税额时，除5000起征点、三险一金等专项扣除外，还允许额外扣除的项目，如子女教育、继续教育、重疾医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人等。2019年1月1日起实施专项附加扣除，转换为月收入的税收计算方法如下：

1、月收入－5000元起征点－三险一金专项扣除－其他依法确定的扣除＝应纳税所得额；

2、所以实发工资＝应发工资－各种扣款。

个人所得税专项扣除如何申报

登陆个税APP，根据要申请的个人所得税专项附加扣除项目填写申报。

1、填报“子女教育”前，需准备子女教育信息，子女、配偶身份证号码，填写完毕后需要设置扣除比例。

2、填报“住房租金”前，需准备好住房租赁信息、工作城市信息等。

3、填报“住房贷款利息”前，需准备好产权证明，贷款合同等信息。

4、填报“赡养老人”前，需准备被赡养人信息如身份证信息，共同赡养人信息（独生子女无需填写）；非独生子女还需填写分摊方式。

注意：纳税人为独生子女的，按照每月2000元的标准定额扣除。

非独生子女需要填写共同赡养人，每人分摊的额度不能超过每月1000元。可以由赡养人均摊或约定分摊，也可以由被赡养人指定分摊。

5、填报“继续教育”前，需准备继续教育信息：

若是学历（学位）继续教育，需填写教育阶段、入学时间、毕业时间；若为职业资格继续教育，则填写教育类型、证书取得时间、证书名称、证书编号、发证机关。

6、填报“大病医疗”前，需准备患者信息和医疗信息。

《中华人民共和国个人所得税法》第六条应纳税所得额的计算：

（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。

（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。

（三）经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。

（四）财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元；四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。

（五）财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。

（六）利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。

劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得以收入减除百分之二十的费用后的余额为收入额。稿酬所得的收入额减按百分之七十计算。

个人将其所得对教育、扶贫、济困等公益慈善事业进行捐赠，捐赠额未超过纳税人申报的应纳税所得额百分之三十的部分，可以从其应纳税所得额中扣除；国务院规定对公益慈善事业捐赠实行全额税前扣除的，从其规定。

本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。