公司在注销前会有严格的公司清算程序，将公司的债务清偿完。要是存在特殊情况的话，则企业注销后的债务就由相关的当事人如股东、董事等承担。如果股东履行了清算义务，那么无论公司是否有足够的财产能够清偿其债务，都不应追究其股东的责任，这正是有限责任本来的结果。但由于股东未完全履行清算责任，导致原告未能申报债权和参与清算，如果该公司清算的结果还有剩余财产，则被股东分配；如果该公司资不抵债，则本应按比例受偿的财产被其他债权人分走，公司股东滥用股东权逃避债务，承担连带责任。

一、已经被起诉的公司能否申请注销

在公司涉及的债权债务关系还在法院诉讼期间，若公司进行注销登记，则无法保证对该案所涉及的债权债务关系进行合理的清算和处理。债权人无法及时依法参与到债权分配中，直接导致债权人的权益难以实现。此外，由于诉讼期间公司被注销登记导致其丧失独立法人资格，即无法作为合法的诉讼主体参与到诉讼中，因此将面临诉讼主体变更问题。此时，该公司的原股东将可能被追加成为案件的当事人，甚至最终承担相应的股东责任。

因此，公司在诉讼过程中不宜进行注销登记，这样既不利于债权人权益的保护，也影响公司的合理清算及股东有限责任的承担。依法合理地进行公司清算，全面彻底地处理公司债权债务后再进行注销登记才是最佳的公司退出市场方式。

通过上面的这些解答，我们可以知道，为了保护各方面的权益、方便后续清算以及股东责任的承担，公司在诉讼过程中，在参与官司时，最好不要进行注销登记。

二、公司清算时遗漏财产如何处理

第一，对于公司已注销后发现公司的遗漏财产，如在诉讼时效之内的，各债权人的债权未能满足的，该财产首先应当按比例分配给公司的债权人；

第二，如果各个债权人的债权已经得到满足的，则公司该财产归属于股东所有，应当按照协议约定分配给各个股东；

第三，如已超过诉讼时效三年，则该财产归属于公司也就是由原股东按出资比例获得财产分配；

第四，如果该公司已消亡且股东也已下落不明，无人主张该项权利的，公司遗漏的财产应当收归国家所有；第五，对于仅仅发现财产线索尚未取回的，只要无人主张权利，法院也无须按照权利进行追索。