预算执行审计开展10年来，积累了很多成功的经验，为促进财政预算管理的规范作出了积极贡献。但新形势下预算执行审计要想跟上财政工作发展步伐，发挥好财政监督作用，也面临许多新问题，需要不断探索新思路、新方法。

一是加强计算机辅助审计工作迫在眉睫。随着会计电算化工作的深化和完善，财政、税务等部门的会计电算化水平已经很高，但不少审计机关的计算机辅助审计工作相对滞后，预算执行审计基本停留在传统的审计方式和模式上，这已经成为制约预算执行审计工作提升审计质量的瓶颈.因此，开发计算机审计软件，在预算执行审计中推进计算机联网审计的步伐，实行真正意义上的计算机辅助审计，是深化和提高预算执行审计工作质量所必需的。

二是对专项资金实行跟踪问效审计，这是促进财政资金提高使用效益的重要手段。经过10年的审计监督，本级财政、税务以及一级预算部门自觉遵守财经纪律的意识明显提高，会计核算基本规范，违纪问题明显减少。但二、三级预算单位相对较差，问题也较多。而这些二、三级预算单位往往是财政专项资金的具体使用单位，专项资金的使用效益如何，是预算支出审计的重要内容。所以，必须加强对专项资金的跟踪问效审计，要顺着财政资金的流向，跟踪审计，一查到底，把审计监督延伸到二、三级预算单位及财政资金的基层使用单位或资金使用项目上，及时查处和纠正各种违纪行为，提高财政资金的使用效益，促进预算执行全方位的健康运行。

三是不断探索对预算管理中新内容的监督方式和方法，适应财政预算管理发展的需求。随着经济的发展，财政预算管理中增添了许多新内容，如转移支付制度、政府集中采购制度、会计集中核算制度等等，这些新事物的出现，就需要预算执行审计跟上财政预算管理发展的步伐，强化对这些新事物的监督，关注转移支付中是否存在违规操作，是否合理、合法；政府集中采购预算编制、招投标制度是否健全、有效；会计集中核算后其管理职能、监督职能是否到位等。要通过有效的审计监督，及时发现和纠正存在的问题，促进预算执行的健康发展。

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