摩托车合格证丢了是可以补办的，机动车所有人应当持行驶证向机动车登记地或者检验合格标志核发地车辆管理所申请补领，车辆管理所应当自受理之日起一日内补发。

一、摩托车异地年检新规定

摩托车申请异地年检需要到机动车所有人身份证明（公户需要到组织机构代码证）记载的住所地址所属车辆管理所分所办理。提交的资料有机动车登记证书或者行驶证、代办人身份证原件、车辆登记地的车管所开具的车辆异地年检委托书和车牌号。机动车在检验地检验合格后，机动车所有人（或代理人）应当填写申请表并持机动车行驶证、机动车交通事故责任强制保险凭证、《委托核发检验合格标志通知书》、和机动车安全技术检验合格证明到被委托地车辆管理所申请机动车检验合格标志。

二、车牌和车子的过户可以一起办吗

车牌和车子的过户不能一起办。但原车辆登记人持有车牌3年以上的，可以在办理过户时申请保留车牌6个月。在此期间，根据规定，车牌可以用于其他无证车辆。根据《机动车登记规定》第十九条的规定，申请转移登记的，现机动车所有人应当填写申请表，交验机动车，并提交以下证明、凭证：

1、现机动车所有人的身份证明；

2、机动车所有权转移的证明、凭证；

3、机动车登记证书；

4、机动车行驶证；

5、属于海关监管的机动车，还应当提交《中华人民共和国海关监管车辆解除监管证明书》或者海关批准的转让证明；

6、属于超过检验有效期的机动车，还应当提交机动车安全技术检验合格证明和交通事故责任强制保险凭证。

现机动车所有人住所在车辆管理所管辖区域内的，车辆管理所应当自受理申请之日起一日内，确认机动车，核对车辆识别代号拓印膜，审查提交的证明、凭证，收回号牌、行驶证，确定新的机动车号牌号码，在机动车登记证书上签注转移事项，重新核发号牌、行驶证和检验合格标志。现机动车所有人住所不在车辆管理所管辖区域内的，车辆管理所应当按照本规定第十三条的规定办理。

三、车辆年审如何办理

车辆年审到车辆管理所办理即可。机动车所有人应当到机动车安全技术检验机构对机动车进行安全技术检验，取得机动车安全技术检验合格证明后申请注册登记。车辆管理所应当自受理申请之日起二日内，确认机动车，核对车辆识别代号拓印膜，审查提交的证明、凭证，核发机动车登记证书、号牌、行驶证和检验合格标志。