占用基本农田2亩的处罚是由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期整改、恢复土地原状，同时没收违法用地新建的建筑物和其他设施、可以并处罚款，构成犯罪的依法追究刑事责任。

1.根据国土资源管理有关规定，征地管理必须执行规划计划、必须充分征求农民意见、必须补偿安置费足额到位才能动工用地、必须公开征地程序和费用标准及使用情况。根据《土地管理法》第七十条规定，县级以上人民政府土地行政主管部门在监督检查工作中发现国家工作人员的违法行为依法应当给予行政处分，且自己有权处理的，应当依法给予行政处分;对于自己无权处理的，应当向同级或者上级人民政府的行政监察机关提出行政处分建议书。

2、对于土地行政主管部门提出的行政处分建议书，有关的行政监察机关必须予以处理。根据《土地管理法》第七十条规定，土地行政主管部门享有直接的行政处分权。对于依照土地管理法律法规应当给予行政处罚，而有关的土地行政主管部门不给予行政处罚的，上级人民政府土地行政主管部门有权给予有关的土地行政主管部门的负责人行政处分。

3、土地行政主管部门发现土地违法行为构成犯罪的处理标准有：根据《土地管理法》第七十一条规定，县级以上人民政府土地行政主管部门在监督检查工作中发现土地违法行为构成犯罪的，应当将案件移送有关机关，主要是指公安机关和检察机关，依法追究刑事责任。对于公安机关或检察机关自行侦破的土地犯罪案件，土地行政主管部门认为刑事处罚后尚不能消除违法后果的，土地行政主管部门仍然可以依法给予行政处罚。

4、对于单位和个人对土地行政主管部门的监督检查配合问题，根据《土地管理法》第六十九条规定，有关单位和个人对土地行政主管部门就土地违法行为进行的监督检查应当支持和配合，并提供工作方便，不得拒绝与阻碍土地管理监督检查人员依法执行职务。

依据《刑法》非法占用农用地罪，犯本罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

最高人民法院楼于审理破坏土地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第三条违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的，依照《刑法》第三百四十二条的规定，以非法占用耕地罪定罪处罚：

(1)非法占用耕地“数量较大”，是指非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上。

(2)非法占用耕地“造成耕地大量毁坏”，是指行为人非法占用耕地建窑、建坟、建房、挖沙、采石、采矿、取上、堆放固体废弃物或者进行其他非农业建设，造成基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上种植条件严重毁坏或者严重污染。