司法鉴定费用的承担问题，按照现有的法律法规规定，鉴定费实行谁主张、谁负担的原则。《诉讼费用交纳办法》中关于鉴定费在第十二条，即在诉讼过程中因鉴定等发生的依法应当由当事人负担的费用，人民法院根据谁主张、谁负担的原则，决定由当事人直接支付给有关机构或者单位，人民法院不得代收代付。但是在现实中，司法鉴定费用的承担，是由根据具体情况由法院判决的。

一、司法鉴定的原则

司法鉴定合法性原则，是指司法鉴定活动必须严格遵守国家法律、法规的规定。它是评断鉴定过程与结果是否合法和鉴定结论是否具备证据效力的前提。

这一原则在立法和鉴定过程中主要体现为：鉴定主体合法；鉴定材料合法；鉴定程序合法；鉴定步骤、方法、标准合法；鉴定结果合法五个方面。

1、司法鉴定机构必须是按法律、法规、部门规章规定，经过省级以上司法机关审批，取得司法鉴定实施权的法定鉴定机构，或按规定程序委托的特定鉴定机构。司法鉴定人必须是具备规定的条件，获得司法鉴定人职业资格的执业许可证的自然人。

2、司法鉴定材料主要是指鉴定对象及其作为被比较的样本(样品)。鉴定对象必须是法律规定的案件中的专门性问题，法律未作规定的专门性问题不能作为司法鉴定对象。如我国现阶段对司法心理测定(俗称测谎)、气味鉴别(警犬鉴定)等尚未作为法定鉴定对象，其鉴定结论不能作为证据。而且鉴定材料的来源(含提取、保存、运送、监督等)必须符合相关法律规定的要求。

3、鉴定程序合法性，包括司法鉴定的提请、决定与委托、受理、实施、补充鉴定、重新鉴定、专家共同鉴定等各个环节上必须符合诉讼法和其他相关法律法规和部门规章的规定。

4、鉴定的步骤、方法应当是经过法律确认的、有效的，鉴定标准要符合国家法定标准或部门(行业)标准。

5、鉴定结果的合法性，主要表现为司法鉴定文书的合法性。鉴定文书必须具备法律规定的文书格式和必备的各项内容，鉴定结论必须符合证据要求和法律规范。

二、司法鉴定机构不接收鉴定的情况

具有下列情形之一的鉴定委托，司法鉴定机构不得受理：

(一)委托事项超出本机构司法鉴定业务范围的；

(二)鉴定材料不真实、不完整、不充分或者取得方式不合法的；

(三)鉴定事项的用途不合法或者违背社会公德的；

(四)鉴定要求不符合司法鉴定执业规则或者相关鉴定技术规范的；

(五)鉴定要求超出本机构技术条件和鉴定能力的；

(六)不符合本通则第二十九条规定的；

(七)其他不符合法律、法规、规章规定情形的。

对不予受理的，应当向委托人说明理由，退还其提供的鉴定材料。

三、司法鉴定协议书的内容

(一)委托人和司法鉴定机构的基本情况；

(二)委托鉴定的事项及用途；

(三)委托鉴定的要求；

(四)委托鉴定事项涉及的案件的简要情况；

(五)委托人提供的鉴定材料的目录和数量；

(六)鉴定过程中双方的权利、义务；

(七)鉴定费用及收取方式；

(八)其他需要载明的事项。