一、如果员工的犯罪行为不是受到单位指派的，单位不承担责任。应该根据单位劳动管理规章制度依规处理。如果制度不健全，可以依照领导办公会的形式给予处理。处理时可以考虑其罪行的性质、程度、刑期以及犯罪的原因，重要的是其在单位的作用和价值，是否还能为单位继续工作，等等。如果还有使用价值，可以考虑保留厂(公司)籍，留厂(公司)查看，服刑期间停发工资，保险中断的处分。也可以直接开除处理。

二、劳动者涉嫌犯罪的，用人单位可以依法解除劳动合同。

根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

(一)在试用期间被证明不符合录用条件的；

(二)严重违反用人单位的规章制度的；

(三)严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；

(四)劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

(五)因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；

(六)被依法追究刑事责任的。

单位犯罪

单位犯罪是指公司、企业、事业单位、机关、团体实施的依法应当承担刑事责任的危害社会的行为。单位犯罪自首是以单位犯罪为前提的，没有单位犯罪，就不可能有自首问题的研究。

其特征：

单位犯罪的主体包括公司、企业、事业单位、机关、团体；

单位犯罪必须是在单位主体的意志支配下实施的；

单位犯罪必须由刑法分则或分则性条文明确规定。对单位犯罪的处罚原则：我国刑法对单位犯罪的处罚以双罚制(即对单位和单位直接责任人员均处以刑罚)为主，以单罚制(即只处罚单位直接责任人员)为辅。

单位故意犯罪的集体意志，在很大程度上是通过决策主体体现出来的。判断犯罪行为是否体现了单位的集体意志，需要看犯罪行为是否经单位负责人决定，否则，无法形成一个单位的犯意。但是，也不能简单的认为，负责人做出了的决定，就可以认定为单位犯罪的意志，这是要具体分析的。例如：个人为进行犯罪违法活动而设立的公司、企业、事业单位实施犯罪的，或者公司、企业、事业单位设立后，以实施犯罪为主要活动的，不以单位犯罪论处。