法院第三方机构鉴定流程具体如下：

1、当事人申请鉴定，应当在举证期限内提出；

2、申请鉴定时，要预交鉴定费用，并提供相关材料；

3、当事人申请鉴定经法院同意后，由双方当事人协商确定有鉴定资格的鉴定机构、鉴定人员，协商不成时，由人民法院指定；

4、当事人对人民法院委托的鉴定部门作出的鉴定结论有异议申请重新鉴定。

法院司法鉴定流程

1、委托：

司法鉴定机构和社会专业司法鉴定人接受司法机关的委托，从事委托请求事项的司法鉴定；非诉讼案件鉴定的受托从其行业规定。

2、受理：

司法鉴定机构收到委托书后，应对委托人的委托事项进行审核，并作出如下决定：鉴定机构受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行。

3、初次鉴定：

鉴定机构受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行。

4、补充鉴定：

司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定，应当对委托人请求的事项进行审查，不属《司法鉴定程序通则》第三十条规定的情形，社会专业司法鉴定机构应当向委托人说明情况，并退回委托书。补充鉴定符合《司法鉴定程序通则》第三十一条规定的情形，社会专业司法鉴定机构可以指定原鉴定人进行，也可以指派其他社会专业司法鉴定人进行，补充鉴定文书是原鉴定文书的组成部分。有下列情形之一的，司法鉴定机构可以接受委托，进行补充鉴定：

（一）发现新的相关鉴定材料；

（二）原鉴定项目有遗漏。

5、重新鉴定：

对重新鉴定，专业司法鉴定机构应当要求委托人提供与原鉴定材料相同的材料。重新鉴定仍在原社会专业司法鉴定机构进行的，不能由原鉴定人承办重新鉴定的事项。有下列情形之一的，司法鉴定机构可以接受委托，进行重新鉴定：

（1）司法鉴定机构、司法鉴定人超越司法鉴定业务范围或者执业类别进行鉴定的；

（2）送鉴的材料虚假或者失实的；

（3）原鉴定使用的标准、方法或者仪器设备不当，导致原鉴定结论不科学、不准确的；

（4）原鉴定结论与其他证据有矛盾的；

（5）原司法鉴定人应当回避而没有回避的；

（6）原司法鉴定人因过错出具错误鉴定结论的。

6、复核鉴定：

对鉴定结论有异议需进行复核鉴定的，其他资质较高的司法鉴定机构可以接受委托，进行复核鉴定。复核鉴定除需提交鉴定材料外，还应提交原司法鉴定文书。

7、司法鉴定文书的出具：

司法鉴定人完成社会专业司法鉴定工作后，应当出具司法鉴定文书。社会专业司法鉴定文书的制作应当符合《司法鉴定程序通则》第三十九条，第四十条，第四十一条，第四十二条规定的要求。司法鉴定文书正本一式三份，其中一份交委托人，两份由司法鉴定机构存档。

8、出庭：

司法鉴定人应当按照司法机关或者仲裁机关的要求按时出庭。司法鉴定人出庭时，应当出示《司法鉴定人执业证书》，依法实事求是的对鉴定结论的依据进行说明，回答与鉴定相关的问题。

对于诉讼的当事人来说，应选择具有鉴定资质的机构为自己进行司法鉴定。如果该鉴定中心不具备相应的鉴定资质或者在鉴定范围内并不包括相应的鉴定项目，即使出具鉴定结果，也没有法律效力。

《司法鉴定程序通则》第十二条委托人委托鉴定的，应当向司法鉴定机构提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对鉴定材料的真实性、合法性负责。司法鉴定机构应当核对并记录鉴定材料的名称、种类、数量、性状、保存状况、收到时间等。诉讼当事人对鉴定材料有异议的，应当向委托人提出。本通则所称鉴定材料包括生物检材和非生物检材、比对样本材料以及其他与鉴定事项有关的鉴定资料。