经济合同签订不当产生的税务风险，包括以下三类。

1、涉外劳务合同签订不当引发的风险。

在上述案例中，甲公司与乙公司实际签署了两份合同，不仅仅签订了设备租赁合同，还签订了一份服务合同，由乙公司派人到境内操作设备，提供服务。

如果甲公司与乙公司不是分别签署租赁合同和劳务合同，而是只签一份服务合同，由乙公司派遣人员，自己带着设备到境内提供劳务，则甲公司就没有因支付租金而需要缴纳关税和增值税的义务了，也就规避了后来被海关查获的少缴税的风险。

2、涉外特许权使用费合同签订不当引发的风险。

境内A公司与境外B公司签订特许权使用费合同，B公司将其某项专利授权A公司使用，A公司每年需支付B公司税后费用100万元，A公司替B公司承担在中国境内的纳税义务。

根据现行有关规定，B公司在中国取得特许权使用费收入，应在中国缴纳5%的营业税(为便于说明问题，暂不考虑增值税)和10%的所得税，由A公司扣缴。如果B公司在中国取得净收入是100万元，则其缴纳营业税和所得税前的收入应该是：

100÷(1-15%)=117.65(万元)。

A公司一共支付117.65万元，其中100万元支付给B公司，5.88万元是替B公司缴纳的营业税，11.77万元是替B公司缴纳的所得税。

A公司在计算企业所得税应纳税所得额时，按照117.65万元在税前扣除，税务局不同意，不允许A公司扣除替B公司缴纳的营业税和所得税，因为替别人负担的税款，不属于与收入有关的成本和费用。这导致A公司被纳税调增17.65万元，多缴所得税4.41万元(17.65×25%)。

如果A公司在与B公司签订合同时，根据B公司希望的净收入，按照应扣缴的税额，换算成含税收入，将合同金额定为117.65万元，则117.65万元都属于支付的特许权使用费，可以在税前扣除，从而避免被纳税调增多缴税的风险。

3、劳动合同签署不当引发的风险。

某些企业在与员工签订劳动合同时，工资收入也是签署税后金额，由公司负担个人所得税，这也导致在计算应纳税所得时，被纳税调增的风险。

假定员工每月净工资3975元，公司负担应纳的个人所得税25元。则公司在所得税前扣除的工资就是3975元。如果将工资总额签订成含税工资，由员工自己负担个人所得税，则可以税前扣除的工资就是4000元，可以减轻所得税负担6.25元。