1、当双方口供不一致时，公安机关会根据不一致的口供，继续收集其他证据，如物证、书证、证人证言、监控录像等，以期能够验证或补充口供内容。公安机关会对双方的口供进行详细核实，了解口供不一致的原因，判断是否存在误解、记忆误差或者故意隐瞒等情况。如果经过调查，证据确实充分，足以证明犯罪事实，公安机关会依法立案；如果证据不足，无法证明犯罪事实，可能会作出不立案的决定。

2、可能会对双方进行补充讯问，以澄清事实，解决口供中的矛盾点。在讯问过程中，公安机关会注意讯问的合法性，避免刑讯逼供等非法手段。公安机关会对收集到的所有证据进行综合评估，判断哪些证据具有可靠性和关联性，哪些证据需要进一步核实。对于已经立案的案件，公安机关在侦查结束后，会将案件材料移送人民检察院审查起诉。

3、根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，公安机关在处理案件时，应当重证据、重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。

4、在整个过程中，公安机关会严格遵守法律规定，确保侦查工作的合法性和公正性。如果口供不一致影响到案件的定性，公安机关会通过其他途径来查明事实真相。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条

对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。

证据确实、充分，应当符合以下条件：

（一）定罪量刑的事实都有证据证明；

（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；

（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。

二、双方口供不一致公安会拘留吗

1、当双方口供不一致时，公安机关会根据具体情况进行处理。如果口供的差异不大，并且能够向执法机关作出合理解释，一般不会立即拘留。然而，如果存在伪造、隐匿、毁灭证据或者提供虚假证言、谎报案情等行为，影响行政执法机关依法办案，那么根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第六十条的规定，可能会被处以5日以上10日以下的拘留，并处200元以上500元以下的罚款。

2、在刑事诉讼中，如果证人、鉴定人、记录人、翻译人对与案件有重要关系的情节故意作虚假证明、鉴定、记录、翻译，意图陷害他人或者隐匿罪证，根据《中华人民共和国刑法》第三百零五条的规定，可能会被处以三年以下有期徒刑或者拘役；情节严重的，可能会被处以三年以上七年以下有期徒刑。

3、总的来说，公安机关会根据案件的具体情况和证据的充分性来认定案件事实，不会仅仅因为口供不一致就立即拘留。证据的充分性和合理怀疑的排除是认定案件事实的重要标准。

《中华人民共和国治安管理处罚法》第六十条

有下列行为之一的，处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款：

（一）隐藏、转移、变卖或者损毁行政执法机关依法扣押、查封、冻结的财物的；

（二）伪造、隐匿、毁灭证据或者提供虚假证言、谎报案情，影响行政执法机关依法办案的；

（三）明知是赃物而窝藏、转移或者代为销售的；

（四）被依法执行管制、剥夺政治权利或者在缓刑、暂予监外执行中的罪犯或者被依法采取刑事强制措施的人，有违反法律、行政法规或者国务院有关部门的监督管理规定的行为。

《中华人民共和国治安管理处罚法》（2012修正）：第三章　违反治安管理的行为和处罚 第四节　妨害社会管理的行为和处罚　　第六十条　有下列行为之一的，处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款：\n（一）隐藏、转移、变卖或者损毁行政执法机关依法扣押、查封、冻结的财物的；\n（二）伪造、隐匿、毁灭证据或者提供虚假证言、谎报案情，影响行政执法机关依法办案的；\n（三）明知是赃物而窝藏、转移或者代为销售的；\n（四）被依法执行管制、剥夺政治权利或者在缓刑、暂予监外执行中的罪犯或者被依法采取刑事强制措施的人，有违反法律、行政法规或者国务院有关部门的监督管理规定的行为。