农村自建房也有土地使用证，土地证是土地所有者或者土地使用者，享有土地所有权或者使用权的法律依据。根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。可见，土地使用证在中国是确认土地使用权的法律凭证。中国的土地分为农民集体所有土地和国家所有土地，所以土地使用证也包括农民集体所有土地使用权证和国有土地使用权证。而其作用主要是为了保障产权安全：通过土地登记对购房人土地合法权益进行保障，经登记的住房用地，如果登记错了，购房人的土地合法权益受到损害，登记机关负赔偿责任；如果没登记，购房人就不能对抗恶意第三人，购房人的土地合法权益就得不到保障。保障交易安全：通过查询住房用地登记资料，可以判定所要购买的房屋土地是否合法，是否有合法的产权，以此保证房屋交易的安全。

农村房屋土地使用证办理流程是怎样的

1、向村委会写出书面申请。

村委会根据村民大会讨论的意见，经村委会审查同意后，张榜公布，张榜七日无异议后，上报审批宅基地名单。

2、填写申请表：村委会同意后，由村负责填写《宅基用地呈批书》签署意见，村长签字，盖村委会公章。

3、乡镇政府审核：乡镇政府根据上报资料到现场进行勘测，经审查合格后，由国土资源所长签字、主管乡（镇）长签署意见并盖乡（镇）政府章，然后上报县国土资源局。

4、县国土资源局接件后，进行资料审核并到现场进行勘测。

5、审核、勘测合格后，报县政府进行审批。

6、审批后张榜公示7日无异议的，国土资源所到现场定点放线，准予开工建设。

7、建设完工后，报国土资源所验收。经验收合格后，由农房科组织相关材料发放《集体土地使用证》。

《土地管理法实施条例》第四条第二款农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。《土地管理法》第十二条土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。