自诉案件中被告人下落不明的，法院是不可以按照缺席判决的。对于自诉案件，人民法院经过审查证据不充分的，或者犯罪已过追诉时效期限的，以及被告人死亡的，应该要说服自诉人撤回起诉，或者裁定驳回起诉。如果经过人民法院调解结案后，自诉人反悔，就同一事实再行告诉的，也可以说服自诉人撤回起诉。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百一十一条：缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

一、刑事自诉案件二审能否撤回

1、自诉人在上诉期满后要求撤回上诉的，应当由第二审人民法院进行审查。如果认为原判决认定事实和适用法律正确，量刑适当，应当裁定准许撤回上诉；如果认为原判决事实不清，证据不足或者将无罪判为有罪、轻罪重判等，应当不准许撤回上诉，并按照上诉程序进行审理。

2、法律依据

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第二百一十一条人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：

(一)犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判；

(二)缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。

法庭审理过程中，审判人员对证据有疑问，需要调查核实的，适用本法第一百九十六条的规定。

二、《刑法》自诉案件条款是什么？

《刑法》当中对自诉案件条款是没有规定的，但是关于自诉类型的案件都是规定在我们国家《刑事诉讼法》当中，其中《刑事诉讼法》

第二百一十条

自诉案件包括下列案件：

(一)告诉才处理的案件；

(二)被害人有证据证明的轻微刑事案件；

(三)被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件。

第二百一十一条自诉案件审查后的处理

人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：(一)犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判；

(二)缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。

自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。

法庭审理过程中，审判人员对证据有疑问，需要调查核实的，适用本法第一百九十六条的规定。

第二百一十二条

人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。本法第二百一十条第三项规定的案件不适用调解。

人民法院审理自诉案件的期限，被告人被羁押的，适用本法第二百零八条第一款、第二款的规定；未被羁押的，应当在受理后六个月以内宣判。

第二百一十三条

自诉案件的被告人在诉讼过程中，可以对自诉人提起反诉。反诉适用自诉的规定。