土地承包经营合同中需要对以下事项作以明确规定：

1、流转土地基本情况及用途

需要写明流转土地的具体位置、地类、面积、界限、用途，原土地承包经营权证编号，原承包合同编号，以及土地流转后使用方对土地的用途。

2、流转期限

需要明确写明流转的年限，自某年某月某日起到某年某月某日止。此处日期要注意符合法律规定的最长时限，并且不可超过土地承包期的剩余期限。另外还要写明交付日期。

3、支付金额、时间、方式

明确约定流转土地以实物形式支付，还是以现金方式支付。明确约定具体每年每亩需要支付的实物种类及公斤数或人民币金额。由于流转期限较长，还可考虑物价等因素另行约定。支付可采取一次性交付或逐年交付。一次性交付的要明确交付日期，逐年交付的约定每年具体交付日期，还可约定每年以多少比率递增。当然，逐年交付也可约定不递增。

4、明确双方权利义务

发包方有权按照合同规定收取转包金，有权按照合同约定到期收土地承包经营权。发包方有权监督承包方合理利用、保护流转土地，有义务协助承包方按合同约定行使土地承包经营权，不干预其正常的生产经营活动。

承包方依法享有经营自主权、产品处置权和收益权。有义务依照合同约定按时足额支付土地转包金。不得擅自改变土地的农业用途，不得随意弃耕、抛荒。转包期满，及时向发包方交还土地，同等条件下享有优先接受流转权。承包方在流转期限内再次流转的，需要经发包方同意，并签订书面补充协议。

5、流转合同到期后地上附着物及相关设施的处理

应明确约定权属及相关补偿措施。

6、合同的变更或解除

双方协商一致，可以解除合同；订立合同所依据的国家政策发生重大变化的可以变更或解除合同；一方违约，使合同无法履行的可以解除合同；承包方丧失经营能力使合同不能履行的可以解除合同；因不可抗力使合同无法履行的可以解除合同。

7、违约责任

双方应当明确约定违约的情形以及承担的违约责任，这样可以促使双方认真履行合同，同时也可以保护守约方的利益。

8、争议解决方式

合同争议双方可协商解决，也可提请村民委员会、乡镇人民政府农村土地承包管理机关调解解决。不愿协商、调解或协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可直接向人民法院提起诉讼。

综上所述，双方签署土地承包合同时要明确内容，如流转土地情况、流转年限等都要作出明文规定，重要的是要在合同中约定双方权利义务，明确违约责任及纠纷解决方式。这样做，虽然不能完全消除纠纷，起码可以在源头减少土地承包经营权流转合同纠纷。