基金财务会计子系统信息化的实现形式主要有两种。一种是社会保险经办机构技术人员根据社会保险财务会计信息化的需要自主开发;一种是与专业财务会计软件公司合作，进行二次开发。

第一种实现方案，功能设置、操作界面等完全按财会人员的要求量身订做，应该说能够按照财务会计信息化的需要进行开发。问题在于，一是多数社会保险经办机构没有足够的技术力量进行自主开发;二是就算有技术力量进行开发也会因为经验等方面的原因，造成程序实际运行不稳定，要经常进行小修小补，操作用户使用并不满意。三是在通用会计核算功能和操作界面的友善性上，更难以达到通用财务会计软件的性能指标。

第二种实现方案应该是最佳的方案。这种方案，在两年前还是不可行的。专业财务软件公司当时尚无法解决好通用财务软件与社会保险业务子系统数据接口的技术问题。但是，现在一些专业财务会计软件公司已经解决了通用财务会计软件与大型数据库接口的技术问题，并在市面上推出了一些以大型数据库技术+三层结构技术+组件开发技术+Web技术+财务管理技术开发的集团级网络财务软件，可以实现财务会计子系统与业务子系统的无缝连结和数据高度共享。无论是在功能的齐备性和性能的稳定性，还是界面的友善性方面都十分优秀。这些通用财务会计软件所缺少的只是与业务子系统实现互联互通、数据共享、互相支持和监督的数据接口模块和实现支持预测、决策管理的方式。这些功能，则完全可以借助专业财务会计软件公司雄厚的技术力量，丰富和成熟的开发经验，通过二次开发来解决。通过二次开发，既能享受到通用财务会计核算的完美功能，又可以满足社会保险财务会计信息化管理的特殊需要，是基金财务会计信息化的最佳实现方案。

在基金财务会计子系统的二次开发过程中，关键是要做好系统建设分析，按照基金征收、拨付业务和决策管理的需要提出正确、详尽的功能模块设计需求，开发好与业务子系统实现互相支持和有效监督的业务数据接口处理模块，如，征收数据处理。社会化退休金发放、单位待遇拨付、医疗保险个人账户注资、失业救济金发放等等。通过这些数据接口处理模块，基金财务会计子系统与社会保险业务子系统才得以实现互联互通、数据共享、互相支持和监督。