1、自制假药在网上销售的，会构成销售假药罪，对犯罪分子判处罚金的，罚金数额按以下方式确定：

(1)、人民法院应当根据犯罪情节，如违法所得数额、造成损失的大小等，并综合考虑犯罪分子缴纳罚金的能力，依法判处罚金数额。

(2)、刑法没有明确规定罚金数额标准的，罚金的最低数额不能少于一千元。

2、法律依据：《最高人民法院关于适用财产刑若干问题的规定》第二条

一、罚金刑的完善。

(一)废除无限额罚金刑。修订的刑法对许多贪利规定罚金的比例或上、下限额等，符合罪刑法定原则，但仍有些犯罪保留了无限额。如果罚金刑不规定相应限额，则往往造成人民法院对罚金判决没有一个统一的量刑标准和参数，极易造成司法实践的混乱，不利于法制统一。

(二)应对贪污受贿犯罪规定相应的罚金刑。在贪污贿赂犯罪中，除了单位、规定了并处罚金外，许多自然人犯罪条款只规定了，且没收财产也只能在犯罪情节特别恶劣的情况下才可并处，出现了量刑幅度不衔接的情况。

(三)罚金数额的确定应与犯罪分子的实际承受能力相吻合。修订的刑法第五十二条规定，判处罚金，应当根据犯罪情节决定罚金数额。犯罪情节轻重，决定了罚金数额的大小。缴纳罚金还应考虑到犯罪分子的经济状况及承受能力。如果罚金过多，超出其负担能力，就会使犯罪分子产生抗拒心理，影响刑罚的适用效果；如果数额过少，就会使犯罪分子感受不到经济惩罚的痛苦，起不到惩罚作用。因此在司法实践中应运用好自由裁量权，其罚金数额应当定位于刑罚执行效果与其实际承受能力的平衡处。

二、判处罚金根据哪些规定确定罚金数额

罚金，是指法院判处犯罪人向国家缴纳一定数额金钱的刑罚方法。罚金属于财产刑的一种。在中国刑法中是一种附加刑。

无论是刑法分则明确规定了罚金刑幅度的，还是没有明确规定罚金刑幅度的，判处罚金刑时都应当根据犯罪情节决定罚金数额。

一般说来，情节严重的，罚金数额应当多些，情节较轻的，罚金数额应当少些，以做到罪刑相适应，使犯罪分子不在经济上占到便宜。

同时，犯罪分子的经济负担能力也是一个考虑的因素。如果罚金数额过多，超过了犯罪分子的实际负担能力，犯罪分子也无法缴纳，这对教育改造犯罪分子也不利；

同时由于罚金刑无法得到实际执行，也损害了法律的严肃性；如果罚金数额过少，则会使犯罪分子感受不到经济惩罚，对犯罪分子起不到惩戒作用。