依据我国相关法律的规定，竞业禁止协议补偿金是单独补偿的，如果协议是约定补偿金包含在工资里面的，协议是无效的。

《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。

对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。

第二十四条竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。竞业限制的范围、地域、期限由用人单位与劳动者约定，竞业限制的约定不得违反法律、法规的规定。

在解除或者终止劳动合同后，前款规定的人员到与本单位生产或者经营同类产品、从事同类业务的有竞争关系的其他用人单位，或者自己开业生产或者经营同类产品、从事同类业务的竞业限制期限，不得超过二年。

一、脱密期与竞业限制条款的差异有哪些

竞业限制条款也是用人单位保守自己的商业秘密的一种措施，即用人单位通过劳动合同或保密协议，约定员工在离职后的一段时间内不得到与该用人单位具有竞争性的企业工作。这是保证商业秘密不被竞争对手获知的一个方法。在这种运作模式下，员工在竞业限制期内不是用人单位的雇员，其与用人单位之间的劳动合同已经终止或解除。

竞业限制义务的根据在于劳动合同中的尚未失效的保密条款或另行签订的保密协议。但是在脱密期内，员工与用人单位之间的劳动合同并未解除，劳动关系仍然存在，员工也仍须遵守用人单位的种种规章制度，只是须离开能接触到商业秘密的部门。这是两种制度的差异所在。

二、竞业禁止协议没有约定补偿金有何法律效力

未约定竞业限制补偿金不必然导致竞业限制协议无效。

根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释四》第六条规定：竞业限制协议中未约定解除或者终止劳动合同后给予劳动者经济补偿，劳动者履行了竞业限制义务的，有权要求用人单位按照劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月平均工资的30％按月支付经济补偿。规定的月平均工资的30％低于劳动合同履行地最低工资标准的，按照劳动合同履行地最低工资标准支付。

1、如果协议中虽然没有约定，但用人单位在双方解除劳动合同后向劳动者支付了竞业限制补偿金，劳动者也接受的，视为双方达成了补充协议并实际履行，竞业限制协议合法有效，并应当按照约定履行。

2、如果双方既没有约定，用人单位也没有在劳动者离职后支付经济补偿金的，此时该协议也不是必然无效，应当区分协议的效力与履行。

（1）如果双方没有约定竞业限制补偿金的，劳动者可以要求与用人单位达成补充协议。

（2）如果双方不能协商一致，用人单位未履行补偿义务，应视为双方解除了该协议，劳动者无需遵守竞业限制义务。

（3）如果劳动者已经按照协议约定履行了竞业限制义务，用人单位仍应当向劳动者支付已经履行竞业限制义务的补偿金，具体的支付标准由双方协商或者是经过司法机关确定。

竞业限制协议签订后，用人单位和劳动你者都有义务履行协议义务。劳动合同解除或终止后，用人单位放弃要求劳动者遵守竞业限制义务，应当向劳动者明示。如果用人单位未向劳动者明示，而劳动者按照竞业限制协议约定履行了竞业限制义务，劳动者有权要求用人单位足额支付补偿金并承担违约责任。

劳动合同解除或终止后，用人单位未及时支付竞业限制补偿金，如果合同没有明确约定，劳动者可以要求用人单位支付补偿金，如果用人单位明确表示不支付或未实际支付，劳动者可以解除竞业限制协议，不遵守竞业限制义务。