被告提出管辖权异议，法院在收到申请后首先应该审查，然后作出书面裁定：异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回，案件继续审理。最后如果当事人对法院的异议裁定不服，可以在收到裁定书之日起10日内上诉，应当向受理的人民法院申请管辖权异议。法院间有争议的提请共同的上级人民法院解决。

一、管辖权异议成立时法院的处理

1、法院对管辖权异议审查后，认为异议成立的，在询问当事人后再由法院作出决定，如果双方当事人对移送的法院不能达成一致意见时，则依管辖法院由原告选择的原则处理，采纳原告的意见。

2、受诉法院收到当事人提出的管辖权异议后，应当认真进行书面审查，必要时需召集双方当事人听证。对当事人所提出的管辖权异议，区别情况作出不同的处理：

（1）当事人就地域管辖权提出异议。经审查，异议成立的，受诉法院依照我国《民事诉讼法》第三十八条的规定，裁定将案件移送有管辖权的法院处理；异议不成立的，裁定驳回。

（2）当事人对裁定不服的，可以在裁定书送达之日起5日内向上一级法院提出上诉。当事人未提出上诉或者上诉被驳回的，受诉法院应通知双方当事人参加诉讼。当事人对管辖权问题申诉的，不影响受诉法院对该案件的审理。

3、当事人就级别管辖权提出异议。级别管辖是上下级法院之间就一审案件审理方面的分工。受诉法院审查后认为确无管辖权的，应将案件移送有管辖权的法院告知双方当事人，但不作裁定。受诉法院拒不移送，当事人向上级法院反映并就此提出异议的，如情况属实确有必要移送的，上级法院应当通知受诉法院将案件移送有管辖权的法院；对受诉法院拒不移送且作出实体判决的，上级法院应当以程序违法为由撤销受诉法院的判决，并将案件移送有管辖权的法院审理。

二、应何时提出管辖权异议？

《民事诉讼法》第三十八条规定：“人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。人民法院对当事人提出的异议，应当审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回。”根据上述规定，当事人提出管辖权异议必须具备以下条件：(1)必须是本案的被告；(2)必须在法定的答辩期间内(被告自收到起诉状副本之日起15日内)提出。逾期提出的，人民法院不予审议。

当事人提出管辖权异议，符合上述两个条件的，法院应当进行审查。对当事人的异议未经审查，或者审查后尚未作出决定的，不得进入对该案的实体审理。经过审查，当事人对管辖权的异议成立的，受诉法院应当作出书面裁定，将案件移送有管辖权的法院。异议不成立的，裁定予以驳回。裁定书应当送达双方当事人。当事人对受诉法院的裁定不服的，在十日内有权向上一级法院提出上诉。在二审法院确定该案的管辖权以后，就应当按照人民法院的通知参加诉讼。